Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience

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Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
13 giugno 2018, Auditorium, Monte Verità, Ascona
      [EMBO Workshop: Bacterial persistence and antimicrobial therapy]

Una crisi che si annuncia: la resistenza
dei batteri agli antibiotici.
Cause, meccanismi, potenziali rimedi.

                       Jean-Claude Piffaretti
                          Interlifescience
                          6900 Massagno
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
 Introduzione: la crisi attuale
 I batteri nel nostro mondo
 Cosa è un battere resistente, come lo diventa
 Ragioni della crisi attuale
 Alcune misure da attuare per rispondere alla
  crisi
 Conclusioni
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Ragioni per il fallimento di una terapia
antibiotica

Resistenza
                Battere
Persistenza

Assorbimento difettoso
Genetica dell’ospite
Ostacoli fisiologici
Terapia interrotta o sotto-dosata (compliance)
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
[Review on Antimicrobial resistance, UK, 2014]
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Costi della resistenza
  numero infezioni
 Antibiotici in sostituzione: più cari
 La resistenza si manifesta con fallimenti
  terapeutici   indagini cliniche e di
  laboratorio;  durata del trattamento
 Ospedale: isolamento, ricerche di portatori,
  misure di decontaminazione
 Pazienti: disconforto, complicazioni;  mortalità
 Ecc.
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Resistenza agli antibiotici in Europa: 2005-2015

             K. pneumoniae e 3GC

             Escherichia coli e 3GC
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Escherichia coli resistente: 3GC

                        OMS, regione Europa, 2016
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Klebsiella pneumoniae multi-resistente: 3GC, FQ, AmG

         Multiresistenza!

                                  OMS, regione Europa, 2016
Una crisi che si annuncia: la resistenza dei batteri agli antibiotici. Cause, meccanismi, potenziali rimedi - interlifescience
Resistenza agli antibiotici: situazione in Svizzera

                                     Bollettino UFSP, 4 giugno 2018
Resistenza agli antibiotici in Svizzera: 2005 - 2015

anresis.ch: Swiss Centre for Antibiotic resistance (from S. Leib, Bern)
Resistenza agli antibiotici: situazione in Svizzera e in Ticino

 anresis.ch

www.anresis.ch
                                         Battere         R antibiotico   CH %   TI %

                                         E. coli         3GC             11.6   10.4

                                         E. coli         FQ              20.7   19.1

                                         S. pneumoniae   Peni            7.7    12
Albrich W. C., Monnet D. L., Harbarth S., 2004, EID: 3:514
Pressione di selezione

                      Quantità
        Popolazioni
                      Tempo di generazione
         batteriche
                      Mobilità genetica

- Str        - Str           + Str           + Str
                                             (- Str)
 Introduzione: la crisi attuale
 I batteri nel nostro mondo
 Cosa è un battere resistente, come lo diventa
 Ragioni della crisi attuale
 Alcune misure da attuare per rispondere alla
  crisi
 Conclusioni
Escherichia coli   Virus influenza
Diversità batterica

Microbiota: popolazione di microrganismi
che colonizza un determinato luogo
Microbioma: totalità del patrimonio
genetico posseduto dal microbiota
Diversità batterica!

  “Batteri”:
      Totale:  1030   • Aerobici
      Suolo:  1029    • Anaerobici
      Acqua:  1028    • Facoltativi
      Umani: 1023
Antibiotici
            Sostanze chimiche,
            prodotte da muffe o
            batteri (o ottenute per
            sintesi) in grado di
            inibire la crescita di
            batteri (antibiotici
            batteriostatici) o di
            ucciderli (antibiotici
            battericidi).

1881-1955   Antibiotico a largo
            spettro: agisce su un
            ampio numero di
            germi.
Istoriato della scoperta degli antibiotici

Sviluppo di nuovi antibiotici: un lungo cammino fino alla loro diponibilità

                                                      J. Antibiotics 67: 7 (2014)
Tossicità selettiva
                                      Parete

 DNA                                  Membrana

 RNA

 Proteine   MI

            1. Sintesi della parete
            2. Sintesi delle proteine
            3. Sintesi degli acidi nucleici
            4. Metabolismo intermedio
CMI = Concentrazione Minima Inibitoria

 La più bassa concentrazione di una sostanza anti-
 microbica capace di inibire la crescita di un batterio

                          Ospite

          Antibiotico                  Battere
Antibiogramma
Sensibilità e resistenza agli antibiotici

Battere sensibile: CMI < Concentrazione umorale

Battere resistente: CMI > Concentrazione umorale
I 5 mecanismi della resistenza agli antibiotici

                                I

                                 II

                        V             III
            A                         IV          B

I: Diminuzione della concentrazione III: Modifica del bersaglio
II: Inattivazione, distruzione      IV: By-pass
V: Protezione del bersaglio
Acquisizione genetica della resistenza
Mobilità genetica della resistenza agli antibiotici

                                       Coniugazione
                                       Trasformazione
                                       Trasduzione

                  +

                                      Trasmissione orizzontale
                                      Trasmissione verticale
TRASPOSIZIONE

      Elementi
    trasponibili

   IS Sequenze d'inserzione

      Tn Trasposoni
Mobilità genetica della resistenza agli antibiotici.
La multiresistenza.
            Fu

     FQ
                     Ap                         Trasposone Tn3
                                        IR    tnA        tnR    bla   IR
          Plasmid         Sm

Tc

                    Su

                                             Integrone
                               int   p att Sm       Su    Tc   Ap
                                                                           Cassetta
Resistoma

Profilo di resistenza agli antibiotici di 480
ceppi batterici isolati dal suolo (Streptomyces)
Science 311: 374 (2006)

                                 Resistoma: pool di geni di
                                 resistenza
Mobilità dei geni di resistenza

             Animali

Ambiente                  Derrate
                          alimentari

           Esseri umani

                                       Microbe (ASM), 4: 231-238 (2009)

                   Approccio One-health
Liu Y.-Y. et al., Lancet Infect. Dis. 16:161 (2016)

                                                         Colistin

                                                                                                Colistin

Martis N. et al., J. Infect. 69:1 (2014)   Ex Miller S.I. et al., Nature Rev. Microbiol. 3:36 (2005)
> 40 paesi, 5 continenti!

       Liu Y.-Y. et al., Lancet Infect. Dis. 16:161 (2016)
Search of the plasmid-mediated colistin resistance (mcr-1 gene)

                                                   Perrin-Guyomard A. et al., Eurosurveillance 21,11 February 2016

                                                                     UK: >24’000 Gram-negative genome sequences:
                                                                     • 10 Salmonella human isolates
                                                                     • 2 Salmonella Para B poultry isolates
                                                                     • 3 E. coli human isolates
                                                                                                     Public Health England, 2015

                                                                        Asia (China, Malaysia, Thailand,
                                                                          Laos, Vietnam)
                                                                        Americas (Canada)
                                                                        Africa (Algeria)
                                                                        Europe (DK, D, F, NE, CH, BE, UK)
        Hasman H. et al., Eurosurveillance 20, 10 December 2015
Origin of the isolates                                               N isolates with the mcr-1 gene

74 ESBL+ Enterobacteriaceae from 21 Swiss rivers and lakes                             1

60 ESBL+ Enterobacteriaceae from imported vegetables (India,
                                                                                       2
  Thailand, Vietnam)

                                                               Zurfuh K. et al., Antimicrob. Agents Chemother., 16 February 2016
Possibili infezioni batteriche                                     Antibiotico

                                                   Infezioni occhio
Meningiti batteriche

                                                   Sinusite

Otite media
                                                     Infezione tratto respiratorio
                                                     superiore
Polmonite

                                                    Gastrite

                                                         Infezione intestinale

Infezioni pelle            Infezione genitale
                                                Infezione tratto urinario
 Introduzione: la crisi attuale
 I batteri nel nostro mondo
 Cosa è un battere resistente, come lo diventa
 Ragioni della crisi attuale
 Alcune misure da attuare per rispondere alla
  crisi
 Conclusioni
Alcune cause della resistenza agli antibiotici

   Uso eccessivo
   Mobilità dei geni batterici
   Prescrizione inappropriata
   Uso intensivo in agricoltura
   Aumento delle infezioni (medicina
    intensiva)
   Mancanza di nuovi (innovativi) antibiotici
Albrich W. C., Monnet D. L., Harbarth S., 2004, EID: 3:514
Fuoco batterico

                                                           Erwinia amylovora

La situazione d'incidenza in Svizzera 2018 (8.06.2018)
Evoluzione della resistenza al ceftiofur nella Provincia Québec, 2003-2008

                                                Dutil L. et al., 2010, Emerg. Infect. Dis. 16: 48
 Introduzione: la crisi attuale
 I batteri nel nostro mondo
 Cosa è un battere resistente, come lo diventa
 Ragioni della crisi attuale
 Alcune misure da attuare per rispondere alla
  crisi
 Conclusioni
Alcune misure da attuare: un approccio One-health

  Aumento delle conoscenze sui potenziali serbatoi
   dei geni di resistenza e dell'efficienza della loro
   trasmissione
  Scoperta di nuove molecole antibatteriche
  Sviluppo di tecniche rapide di diagnosi
  Sviluppo di misure d'intervento efficienti

         Migliore gestione degli antibiotici /
         Diminuzione del consumo di antibiotici
L'identificazione e lo sviluppo di nuovi
antibiotici sono troppo lenti!
 Ricerca, sviluppo, autorizzazione: tempi lunghi
 Vuoto finanziario tra l'identificazione di molecole
  interessanti e la ricerca pre-clinica e clinica
 Costi della ricerca clinica
 Durata limitata delle patenti (20 anni)
 Interesse assente o limitato dell'industria farmaceutica
 …

                                    GAIN Act:
                                    “Generating Antibiotic Incentives Now”
Costi e guadagni per un medicinale standard (non
antibiotico

                                                             Market                           Patent
                                                          authorization                       expiry

                                                                           Sales

                                                                                                                       time
                             R&D-costs

  Basic research/preclinic         Clincal phases I-III                      Sales                      Sales
          >5 years                      about 7y                    8-12y Patent protection      Generic competition

                                                                                                    Courtesy of R. Blankart
Costi e guadagni per un antibiotico

                                                           Market
                                                        authorization
                                                                        Sales revenues
                                                                                 time
                           R&D costs

Basic research/preclinic         Clincal phases I-III                    Sales
        >5 years                      about 7y                  8-12y Patent protection

                                                                        Courtesy of R. Blankart
Push incentives have a direct while Pull-incentive have an indirect
effect on R&D activities
Push- and Pull-Incentives

                                                                     Pull-
                               Push-incentives
                                                                  incentives

                                                                                 time

                  JPIAMR                                                GAIN
                           Horizon 2020 IMI/ND4BB
                                                    BARDA
                                  NIH/NIAID
                               Wellcome Trust
               National Research Agencies
                              CARB-X
                                        GARD-P
                                                 EIB‘s InnovFin
            UK/China Global Innovation Fund                             Courtesy of R. Blankart
                                                                                                  52
Completely delinked market entry premiums for the development of
new antibiotic substances
Market entry premiums

                                   Market entry premiums

            R&D costs                                              time

                               Annual premiums paid after
                               development of the defined active
                               substance, irrespective of sales
                               volume

                                              Sales
                                     8-12y Patent protection

                                                                      Courtesy of R. Blankart
                                                                                                53
 Introduzione: la crisi attuale
 I batteri nel nostro mondo
 Cosa è un battere resistente, come lo diventa
 Ragioni della crisi attuale
 Alcune misure da attuare per rispondere alla
  crisi
 Conclusioni
È urgentemente necessario
di agire in una prospettiva
globale!

Tutti gli utilizzatori di antibiotici hanno un
ruolo cruciale per risolvere/attenuare la
crisi!
What Switzerland is doing
1999   Ban of antibiotics as feed additives (growth promoters)
2001   NRP 49 “Antibiotic Resistance” (CHF 12 millions)
2015   StAR (Strategy on Antibiotic Resistance)
2015   NRP 72 “Antibiotic Resistance: a one-health approach” (CHF 20 millions)
2017   World Antibiotic Awareness Week (WHO)
2017   RT on Antibiotics: Appeal by science and industry to make more effective use of
       Switzerland's innovative capacity to fight antibiotic resistance and to develop new
       antibiotics

       Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance (JPIAMR)
       New Drugs for Bad Bugs" (ND4BB)
       DRIVE-AB (Driving reinvestment in R&D for antibiotics and advocating their
       responsible use)
       WHO's "Global Action Plan on Antimicrobial Resistance"
       etc.
La Strategia contro le resistenze agli
                                 antibiotici (StAR) ha l’obiettivo di
Approccio One-heath: 4 settori   assicurare a lungo termine l’efficacia degli
che interagiscono (umano,        antibiotici. Nella sua attuazione sono
animale, agricolo, ambientale)   coinvolti l’uomo, gli animali e l’ambiente.
                                 L’USAV è responsabile delle misure che
                                 interessano gli animali.
13 al 19 novembre 2017

Settimana mondiale per
l’uso prudente di antibiotici
(World Antibiotic
Awareness Week)
Grazie per l’attenzione!
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