SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA

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SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
Sperimentazione progetto InFSE
      Regione Calabria
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
Logical
   Observation
   Identifiers
   Names and
   Codes
Sistema di codici universali per lo scambio e
la condivisione di dati clinici e di laboratorio
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
Perché LOINC?
   “All’interno di un laboratorio possono essere
   usati termini appartenenti ad un gergo locale
   solitamente ben compresi fra colleghi, ma non
   sufficientemente conosciuti per essere usati
   per comunicare con il mondo esterno”

(tradotto da U. Forsum et al., Pure Appl. Chem 72:555-745, 2000 Properties and Units in the
Clinical Laboratory Sciences Part VII. Properties and Units in Clinical Microbiology)
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
Un esempio

   Nomenclatore Tariffario Regione Piemonte:
      • Esame  90.02.2 Acido Citrico

                                     Codice   Descrizione
Ospedale Civile Edoardo Agnelli,     1183       Citrato
Pinerolo (TO)
ASL Alessandria                      9835      Citraturia
Azienda Ospedaliero- Universitaria   8519     Ammoniuria
San Luigi Gonzaga, Orbassano (TO)
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
Se una osservazione è una domanda e il valore
  dell’osservazione è una risposta…

…LOINC fornisce codici per le domande
Altri vocabolari (ICD, SNOMED, etc) forniscono
  codici per le risposte
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
Il Regenstrief Institute
• crea LOINC nel 1994 per rispondere alla crescente necessità di
trasmettere elettronicamente informazioni cliniche dai
laboratori che le producono agli ospedali e agli studi medici che
le utilizzano per la cura ed il trattamento dei pazienti;

• mantiene ed aggiorna il database LOINC;

• sviluppa i tool per la ricerca ed il mapping;

• gestisce la community LOINC;

• distribuisce release semestrali del database LOINC aggiornato.
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Codici LOINC nel tempo e nello spazio
                           Ultima release
                            30-12-2012
                        Più di 70.000 codici

Più di 19.000
utenti in 149                    Prima release
Paesi nel mondo                   24-4-1995
                              Meno di 10.000 codici
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LOINC international

Dal 2009, 84 organizzazioni di 14 Paesi differenti
contribuiscono allo sviluppo di LOINC

LOINC è attualmente tradotto in 9 lingue e 16
varianti linguistiche

18 organizzazioni sono impegnate nel creare,
mantenere ed aggiornare traduzioni di LOINC in
lingue diverse dall’inglese.
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
LOINC Laboratorio
Misurazioni o osservazioni su un campione

Quale è il livello di emoglobina del mio
paziente?

718-7:Emoglobina:MCnc:Pt:Sangue:Qn
SPERIMENTAZIONE PROGETTO INFSE REGIONE CALABRIA
LOINC Clinico
     Misurazioni o osservazioni su un paziente

  Quanto velocemente cammina di solito il mio
  paziente?

41959-8:Velocità di cammino:Vel:1sett^media:^Paziente:Qn:Calcolato
LOINC nei messaggi elettronici HL7 v.2.X
Identificare osservazioni nel flusso informativo fra
diversi provider di cura
        Codice                                         Sistema di
        osservazione                                   codifica (LOINC)

OBX||CE|57131-5^Neonato, condizioni con marcatori positivi^LN||7573000^PKU^SCT

                         Descrizione              Codice risultato
                         osservazione             ^Descrizione risultato
                                                  (fenilchetonuria)
                                                  ^Sistema di codifica (SNOMED-CT)
Struttura di un termine LOINC
                 identificativo univoco
Codice LOINC    progressivo senza significato intrinseco

1. Component/Analita
2. Property
3. Time                           6 assi
4. System/Campione                principali
                                  LOINC
5. Scale
6. Method
Asse 1: Component
:::::

               Nome del componente o analita strutturato
                   (ad es. Glucosio, propanolo, ecc.)
Asse 2: Property
:::::

                           la proprietà osservata
                     (es., concentrazione di sostanza,
                               massa, volume)
Asse 3: Time
:::::

                             tempo della misurazione
                          (ad es., è nel corso del tempo o
                                   momentaneo)
Asse 4: System
:::::

                              il tipo di campione
                           (per esempio, urina, siero)
Asse 5: Scale
:::::

                            la scala di misurazione
                           (per esempio, qualitativa,
                                 quantitativa)
Asse 6: Method
:::::

                          il metodo della misurazione (per
                            esempio, radioimmunologico)
Esempio
                          Property:
Codice LOINC:             caratteristica o          System: tipo di        Method:
progressivo               attributo dell’analita,   campione su cui        metodica di
univoco con               che è misurata,           l’osservazione viene   realizzazione del
check digit finale        valutata o osservata      effettuata             test (opzionale)

5792-7:Glucosio:MCnc:Pt:Urine:Qn:Test strip
   Component:                 Time: intervallo di      Scale: scala di
   sostanza o entità          tempo in cui             misurazione
   che è misurata,            l’osservazione o la
   valutata o osservata       misurazione viene
                              effettuata
Cosa non codifica LOINC
•   Lo strumento usato per effettuare l’esame;
•   Dettagli specifici sul campione;
•   Priorità;
•   Dove è stato eseguito l’esame;
•   Chi ha eseguito l’esame;
•   Interpretazione dell’esame.
1. Component: (1)
                                   √ SI                                 X NO

Abbreviazioni Quelli universalmente condivisi (ad es. Acronimi di esclusivo utilizzo in
 ed acronimi               Ab, DNA, ecc)                     lingua italiana

                                                           Utilizzo delle marche dei farmaci
Nome farmaci                    Propanolo
                                                                      (es. Inderal)
                   Utilizzo del nome tassonomico di un     Utilizzo del nome della malattia
Virus/organis
                              virus/organismo                   (Febbre maculosa delle
     mi
                        (Es. Rickettsia rickettsii, Ab)           Montagne Rocciose)

                       Utilizzare il nome chimico:
   Vitamine                                                          Vitamina B1
                             Ad es.: Tiamina
                   Specificare se si misura l’antigene o
Test Sierologici                                                  “Anticorpi anti X”
                                l’anticorpo
1. Component: (2)

                                                               Utilizzo del nome dell’acido
                      Utilizzo del nome anionico
    Acidi                                                    acido lattico, acido citrico, acido
                     Ad es.: Lattato, citrato, urato
                                                                            urico

                       Utilizzo del nome singolo
    Alcoli                                                      alcol metilico, alcol etilico
                      Ad es.: metanolo, etanolo

                         Specificarle per esteso
Lettere greche                                                         A-tocoferolo
                         Ad es.: alfa tocoferolo

                 Evitare l’utilizzo delle parole “totale”,
Denominazioni
                           “diretta”, “indiretta”                    Bilirubina totale
  composte
                             Ad es.: Bilirubina
                    Specificare sempre per esteso
  Estensioni           denominazioni come:                          10-OH-carbazepine
                       10-idrossicarbazepina
Test di provocazione:
         cosa cambia nel Component
Component

Glucosio^1h post 100 g glucosio per os
  Sottoparte 1:       Sottoparte 2:   Sottoparte 3:   Sottoparte 4: via di
  intervallo di tempo tipo di         sostanza        somministrazione
  trascorso dopo la   provocazione    somministrata
  provocazione                        /trattamento
                                      effettuato
2. Property (tipo di quantitità)
        CATEGORIE PRINCIPALI   Descrizione
MASSA                          Osservazioni riportate con massa ( grammi, milligrammi, ecc
SOSTANZA                       Osservazioni riportate con moli o milliequivalenti nel numeratore dell’unità di
                               misura
ATTIVITÀ CATALITICA            Osservazioni che riportano attività enzimatica
ARBITRARIO                     Risultati che riportano unità arbitrarie nel numeratore dell’unità di misura

NUMERO                         Conte ematiche
           SOTTOCATEGORIE      Descrizione
MASSA                          Osservazioni riportate con massa ( grammi, milligrammi, ecc
SOSTANZA                       Osservazioni riportate con moli o milliequivalenti nel numeratore dell’unità di
                               misura
ATTIVITÀ CATALITICA            Osservazioni che riportano attività enzimatica
ARBITRARIO                     Risultati che riportano unità arbitrarie nel numeratore dell’unità di misura

NUMERO                         Conte ematiche
CONCENTRAZIONI                 Quantità/volume
CONTENUTI                      Quantità/massa
RAPPORTI                       Risultato riportato come una misurazione diviso un’altro effettuato sullo stesso
                               campione
FRAZIONI                       Parte/ Tutto
INDICI                         Misurazione su un periodo di tempo
2. Property (tipo di quantitità)
                           ESEMPI DI COMBINAZIONE DI CATEGORIE PRINCIPALI E SOTTOTIPI

                 MCnc                                                           MASSA/UNITÀ VOLUME
(CONCENTRAZIONE DI MASSA)                                                               (ES. MG/DL);
                 MCnt                                                          MASSA/UNITÀ DI MASSA
   (CONTENUTO DI MASSA)                                                                 (ES. MG/GM)
          NCnc
                                                                                      CONTA/VOLUME
 (NUMBER CONCENTRATION)
          CCnc                                                                     ATTIVITÀ CATALITICA
(CONCENTRAZIONE CATALITICA)                                                     (ES. IU/ML, UNITS/ML)
                  Prid                                             SET FINITO DI RISULTATI A TESTO LIBERO,
   (PRESENZA O IDENTITÀ)                                                INDIPENDENTI E NON CLASSIFICATI

                 MRat                                                            QUANTITÀ/INTERVALLO
                                                                                        (ES. G/24H)
       (INDICE DI MASSA)
  * LE SIGLE CHE INDICANO LE PROPRIETÀ NON SONO STATE TRADOTTE IN ITALIANO, IN QUANTO ELEMENTI PROPRI DEL SISTEMA LOINC
3. Time
      ESEMPI DI VALORI
                   MISURAZIONE IN UN DETERMINATO MOMENTO,
PT                       SINONIMO DI ‘SPOT’ E ‘RANDOM

12H             MISURAZIONE SU UN INTERVALLO DI TEMPO DI 12 ORE

                NON SPECIFICATO O NON COMPRESO NELLE CATEGORIE
XXX                               DISPONIBILI
4. System/Campione

                                             ESEMPI DI VALORI
                          SIERO

                     SANGUE ART                                            SANGUE ARTERIOSO

                         PPP                                           PLASMA POVERO DI PIASTRINE
                         URINE
                                                   SOTTOPARTI
           UNITÀ PRODOTTO SANGUE                                 (ES. SIERO^UNITÀ PRODOTTO SANGUE)
                    FETO
        DONATORE DI MIDOLLO OSSEO
* LE SIGLE E LE ABBREVIAZIONI DEL MASTER INGLESE SONO STATE:
1. MANTENUTE IN ITALIANO SE COMUNEMENTE USATE;
2. RESE CON SIGLE ED ABBREVIAZIONI ITALIANE CORRISPONDENTI SE ESISTENTI;
3. TRADOTTE CON LA FORMA ESTESA DEL NOME.
5. Scale
    TIPOLOGIA                                   DESCRIZIONE
                                 Il risultato è un valore numerico di una scala
           QN                    numerica continua (numero intero, rapporto,
     (QUANTITATIVA):             numero reale o range).
                                 Es: 7, -7,
6. Method
  Campo opzionale, specificato solo quando lo
  stesso test, realizzato con metodi differenti,
  restituisce risultati con diverso significato
  clinico.

Livello di dettaglio generico:
• HA - Agglutinazione: include diretta ed
  indiretta;
• EIA: include varianti come ELISA.
Il mapping
                  Cosa è
Stabilire corrispondenze univoche tra i codici
locali ed i codici LOINC

Codice esame                           Codice
laboratorio X                          LOINC
                                                 Chi lo deve fare

                   Come
Preparazione dei dati
Come strutturare la lista esami interna al singolo laboratorio (.csv o .txt)

 Le batterie di esami devono essere disaggregate, specificando nel
 dettaglio ciascun esame che è parte del gruppo, anche se questo dovesse
 eventualmente comportare ripetizioni. Ciò che si andrà a mappare è,
 difatti, il singolo test e non la batteria di esami nel suo insieme.
www.loinc.org
LOINC Users’ Guide
Impostare la lingua di ricerca
Impostare la lingua di ricerca - italiano
Importare esami locali in RELMA
Importare esami laboratorio
            Assegnare
            nome al file
            importato
La schermata di mapping

   Denominazione
   esame locale
Suggerimenti per il mapping

         Doppio clic sul codice candidato
            al mapping per inserire
         commenti/dubbi/considerazioni
                sul codice scelto
Suggerimenti per il mapping

          Clic con tasto destro sul
          codice per visualizzare
          schermata di dettaglio
         (secondo diversi livelli di
                 specificità)
Non trovi il tuo esame in LOINC?
• Prova a ricercare mediante forme grafiche
  differenti

• Prova a ricercare mediante sinonimi

• Usa caratteri jolly come *. Es: fenil*

• Usa la denominazione inglese, se la conosci
Esportazione dei mappings
Esportazione dei mappings
Bisogno
                     d’aiuto?

www.loincitalia.it

                                AND
Mapping già effettuati da altri utenti LOINC
Step successivi

• Verifica e validazione dei
  mapping effettuati

• Implementazione del flusso
  informativo con il Fascicolo
  Sanitario Elettronico
Question and Answer
Grazie per l’attenzione!

chiaravalloti@icar.cnr.it
erika.pasceri@unical.it
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