Ricerche bibliografiche In PubMed - Corso di information literacy per gli studenti dei corsi di Medicina e Chirurgia - Unibo

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Ricerche
bibliografiche
In PubMed
Corso di information
literacy per gli studenti
dei corsi di Medicina e
Chirurgia

Area Biblioteche e Servizi allo Studio
Settore Biblioteca di Medicina
Agenda

Banca dati PubMed/MEDLINE
  Caratteristiche e Contenuti
  Modalità di impostazione di una ricerca
   Modalità di presentazione dei risultati
  Analisi e valutazione/riutilizzo dei risultati
Obiettivi

 Obiettivo del corso è renderti in grado di:
    Definire concetti e termini che identificano l’argomento
    Utilizzare quei termini per impostare una ricerca bibliografica
    Usare le opzioni offerte dalla banca dati (filtri, ordinamenti)
    Valutare i risultati, cambiando la ricerca se necessario
1. PubMed/MEDLINE

Argomenti
   Contenuti della banca dati
   Integrazione con altre risorse/banche dati
   Modalità di accesso alla risorsa
   Elementi di un record descrittivo di un articolo
   Il vocabolario controllato di PubMed: MeSH
Breve storia dell’indicizzazione della letteratura
biomedica
Index medicus
Pubblicata dal 1879; continuazioni fino al 2004
Opera (ovviamente) a stampa
Periodico: Fascicoli trimestrali, poi mensili
MEDLINE
Nasce nel 1971
Oltre 25 mln di record bibliografici
Oltre 5200 riviste in oltre 40 lingue (93% in inglese)
Copertura; per la maggior parte 1966- (ma anche record
precedenti fino al 1946: OLDMEDLINE)
Aggiornamento giornaliero
Indicizzazione per soggetto (MeSH)
87% degli articoli post 2010 corredati di abstract, ora structured
Breve storia dell’indicizzazione della letteratura
biomedica

PubMed
risorsa gratuita sviluppata e gestita dal National Center for
Biotechnology Information (NCBI) presso la National Library of
Medicine (NLM) USA
Contenuti
Record di MEDLINE
PMC (PubMed central)
Record pre-MEDLINE (forniti direttamente dagli editori)
Record non-MEDLINE
Selezione di ebook
Banche dati fattuali
PMC

Cos’è
Archivio di articoli a testo completo (full text) e ad accesso libero
Nasce nel 2000
Gestito dal NLM’s National Center for Biotechnology Information
(NCBI).
Cosa contiene
5,3 mln di articoli
3240 riviste (full participants+NIH portfolio)
Altre 5000 riviste selective deposit
Ecosistema PubMed
Accesso alla risorsa

PubMed settato per l’Università di Bologna

Vantaggi
Controllo della disponibilità dei full text attraverso il catalogo delle
riviste online disponibili per Unibo
Accesso diretto a Nilde in caso di indisponibilità del full text
online…
…o dell’articolo accessibile sulla rivista a stampa in biblioteca!
Link diretto dal sito Web della Biblioteca Clinica
La struttura del record in PubMed/MEDLINE

                  PMID: 25997105
Elementi identificativi di un articolo

Journal Source Information

Title of the journal article

Language in which the article was published (if not English)

Names of the Authors

Author affiliation and information

Abstract published with the article

Publication Type (description of the type of article, e.g., Review, Letter,
etc.)

Controlled Vocabulary search terms (Medical Subject Headings)
MeSH: non semplicemente parole chiave

Medical Subject Headings
Struttura gerarchica (ad albero): dal generale al particolare
Vocabolario controllato di termini
Manutenzione costante del vocabolario (aggiornamento annuale)
Rispetto del principio dell’uniformità e della coerenza
 1 solo termine valido per un dato concetto usato in letteratura
 Connessione con i termini NON accettati (entry terms)
 Connessione con i termini sostituiti (previous indexing)
 Articoli che trattano il medesimo topic condividono (almeno in
   parte) i MeSH
MeSH: non semplicemente parole chiave
Categorie
Headings
Subheadings (Qualifiers)
Publication types
Geographics
Supplementary concepts
       Sostanze
       Organismi
       Protocolli

Da ricordare ai fini della interrogazione
Major topics
Automatic explosion
Presenza di record non (ancora) indicizzati

Esempio di record descrittivo di un termine
MeSH: non semplicemente parole chiave

Esercizio

    Trattamento chirurgico del tumore alla prostata

Ricerca libera per parola chiave
Ricerca per soggetto con i termini del vocabolario*
Ricerca libera per parola chiave usando i termini MeSH
* Provare anche a restringere sul major topic e a escludere i
soggetti sotto ordinati nella gerarchia
2. La conduzione di una ricerca

Argomenti
   Scelta dei termini
   Come PubMed traduce una ricerca semplice per parole chiave
   Filtri
   Operatori logici (Booleani): AND OR NOT
   La ricerca avanzata
La conduzione di una ricerca: raccomandazioni

Dalla frase-titolo alle parole chiave
Traduzione in inglese delle parole chiave
  dizionari scientifici bilingui
 Focus sui termini da usare, NON sulla sintassi
 Usare termini quanto più specifici
 Evitare uso di asterischi, virgolette, trattini
 Verificare la traduzione dei termini fatta da
  PubMed: Search details
La conduzione di una ricerca: opzioni disponibili
I filtri
   Consentono di ridurre i risultati
   Possono essere combinati (operatore: OR)
   Rimangono memorizzati per tutta la sessione di lavoro
   Personalizzazione della visualizzazione
Opzioni disponibili
   Data/Tipo di pubblicazione
   Disponibilità dell’articolo (full-text)
   Specie (Humans, Animals)
   Età/Sesso
   Soggetti predefiniti (generano una search strategy)
   Categorie di periodici
   Indici di ricerca (autore, titolo, soggetto…)
Novità 2019

Systematic reviews diventa una voce di MeSH nella categoria Pub Type

Attualmente compare in due posizioni tra i filtri:

Publication Type
Subjects (subset di ricerca per soggetto)

Il risultato è il medesimo
Un esempio

Esercizio

      Trattamento farmacologico del dolore post-operatorio
    dopo colecistectomia laparoscopica nel paziente anziano

Una volta impostata la ricerca, selezionare solo le revisioni sistematiche
Problemi e verifiche

   Post operative, postoperative, post-operative?
   Elderly come parola chiave oppure utilizzo dei filtri?
   Pharmacological treatment: a cosa corrisponde in MeSH?
   Quali sono le opzioni di filtro sulle revisioni sistematiche?
   Come sono stati utilizzati gli operatori booleani?
La conduzione di una ricerca: opzioni disponibili

Navigazione tra i risultati
Best match
 Ordinamento per rilevanza
 Apparente maggiore precisione nella risposta
 Verificare gli Additional terms
Most recent
 Visualizzazione «classica» dei risultati
 Verificare i Search details, soprattutto per le traduzioni nei MeSH
Similar articles
 A partire da una singola citazione
 Tenere in considerazione in particolare le reviews
La conduzione di una ricerca: la ricerca avanzata

Costruzione della ricerca con la «logica dei mattoni Lego®»
 Ogni mattone una parola chiave
 Ogni parola chiave può essere cercata in un campo specifico
  (Title word, abstract, subject)che nella conduzione della ricerca
  si traduce in un marcatore (tag)
 Il legante sono gli operatori booleani

Visualizzazione e riutilizzo della Cronologia (Search history)
 Replica di una ricerca (sessione di 8 ore, max 100 ricerche
   memorizzate, cronologia di 6 mesi con login a MyNCBI)
 Combinazione di più ricerche (operatori booleani)
 Salvataggio di una o più ricerche in MyNCBI
Massimo Urbini
ABIS – Settore Biblioteca di Medicina
   Biblioteca Clinica F.B. Bianchi

       massimo.urbini@unibo.it
            051 2087377

         https://sba.unibo.it/it
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