Ricerche bibliografiche In PubMed - Corso di information literacy per gli studenti dei corsi di Medicina e Chirurgia - Unibo
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Ricerche bibliografiche In PubMed Corso di information literacy per gli studenti dei corsi di Medicina e Chirurgia Area Biblioteche e Servizi allo Studio Settore Biblioteca di Medicina
Agenda Banca dati PubMed/MEDLINE Caratteristiche e Contenuti Modalità di impostazione di una ricerca Modalità di presentazione dei risultati Analisi e valutazione/riutilizzo dei risultati
Obiettivi Obiettivo del corso è renderti in grado di: Definire concetti e termini che identificano l’argomento Utilizzare quei termini per impostare una ricerca bibliografica Usare le opzioni offerte dalla banca dati (filtri, ordinamenti) Valutare i risultati, cambiando la ricerca se necessario
1. PubMed/MEDLINE Argomenti Contenuti della banca dati Integrazione con altre risorse/banche dati Modalità di accesso alla risorsa Elementi di un record descrittivo di un articolo Il vocabolario controllato di PubMed: MeSH
Breve storia dell’indicizzazione della letteratura biomedica Index medicus Pubblicata dal 1879; continuazioni fino al 2004 Opera (ovviamente) a stampa Periodico: Fascicoli trimestrali, poi mensili MEDLINE Nasce nel 1971 Oltre 25 mln di record bibliografici Oltre 5200 riviste in oltre 40 lingue (93% in inglese) Copertura; per la maggior parte 1966- (ma anche record precedenti fino al 1946: OLDMEDLINE) Aggiornamento giornaliero Indicizzazione per soggetto (MeSH) 87% degli articoli post 2010 corredati di abstract, ora structured
Breve storia dell’indicizzazione della letteratura biomedica PubMed risorsa gratuita sviluppata e gestita dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) presso la National Library of Medicine (NLM) USA Contenuti Record di MEDLINE PMC (PubMed central) Record pre-MEDLINE (forniti direttamente dagli editori) Record non-MEDLINE Selezione di ebook Banche dati fattuali
PMC Cos’è Archivio di articoli a testo completo (full text) e ad accesso libero Nasce nel 2000 Gestito dal NLM’s National Center for Biotechnology Information (NCBI). Cosa contiene 5,3 mln di articoli 3240 riviste (full participants+NIH portfolio) Altre 5000 riviste selective deposit
Ecosistema PubMed
Accesso alla risorsa PubMed settato per l’Università di Bologna Vantaggi Controllo della disponibilità dei full text attraverso il catalogo delle riviste online disponibili per Unibo Accesso diretto a Nilde in caso di indisponibilità del full text online… …o dell’articolo accessibile sulla rivista a stampa in biblioteca! Link diretto dal sito Web della Biblioteca Clinica
La struttura del record in PubMed/MEDLINE PMID: 25997105
Elementi identificativi di un articolo Journal Source Information Title of the journal article Language in which the article was published (if not English) Names of the Authors Author affiliation and information Abstract published with the article Publication Type (description of the type of article, e.g., Review, Letter, etc.) Controlled Vocabulary search terms (Medical Subject Headings)
MeSH: non semplicemente parole chiave Medical Subject Headings Struttura gerarchica (ad albero): dal generale al particolare Vocabolario controllato di termini Manutenzione costante del vocabolario (aggiornamento annuale) Rispetto del principio dell’uniformità e della coerenza 1 solo termine valido per un dato concetto usato in letteratura Connessione con i termini NON accettati (entry terms) Connessione con i termini sostituiti (previous indexing) Articoli che trattano il medesimo topic condividono (almeno in parte) i MeSH
MeSH: non semplicemente parole chiave Categorie Headings Subheadings (Qualifiers) Publication types Geographics Supplementary concepts Sostanze Organismi Protocolli Da ricordare ai fini della interrogazione Major topics Automatic explosion Presenza di record non (ancora) indicizzati Esempio di record descrittivo di un termine
MeSH: non semplicemente parole chiave Esercizio Trattamento chirurgico del tumore alla prostata Ricerca libera per parola chiave Ricerca per soggetto con i termini del vocabolario* Ricerca libera per parola chiave usando i termini MeSH * Provare anche a restringere sul major topic e a escludere i soggetti sotto ordinati nella gerarchia
2. La conduzione di una ricerca Argomenti Scelta dei termini Come PubMed traduce una ricerca semplice per parole chiave Filtri Operatori logici (Booleani): AND OR NOT La ricerca avanzata
La conduzione di una ricerca: raccomandazioni Dalla frase-titolo alle parole chiave Traduzione in inglese delle parole chiave dizionari scientifici bilingui Focus sui termini da usare, NON sulla sintassi Usare termini quanto più specifici Evitare uso di asterischi, virgolette, trattini Verificare la traduzione dei termini fatta da PubMed: Search details
La conduzione di una ricerca: opzioni disponibili I filtri Consentono di ridurre i risultati Possono essere combinati (operatore: OR) Rimangono memorizzati per tutta la sessione di lavoro Personalizzazione della visualizzazione Opzioni disponibili Data/Tipo di pubblicazione Disponibilità dell’articolo (full-text) Specie (Humans, Animals) Età/Sesso Soggetti predefiniti (generano una search strategy) Categorie di periodici Indici di ricerca (autore, titolo, soggetto…)
Novità 2019 Systematic reviews diventa una voce di MeSH nella categoria Pub Type Attualmente compare in due posizioni tra i filtri: Publication Type Subjects (subset di ricerca per soggetto) Il risultato è il medesimo
Un esempio Esercizio Trattamento farmacologico del dolore post-operatorio dopo colecistectomia laparoscopica nel paziente anziano Una volta impostata la ricerca, selezionare solo le revisioni sistematiche
Problemi e verifiche Post operative, postoperative, post-operative? Elderly come parola chiave oppure utilizzo dei filtri? Pharmacological treatment: a cosa corrisponde in MeSH? Quali sono le opzioni di filtro sulle revisioni sistematiche? Come sono stati utilizzati gli operatori booleani?
La conduzione di una ricerca: opzioni disponibili Navigazione tra i risultati Best match Ordinamento per rilevanza Apparente maggiore precisione nella risposta Verificare gli Additional terms Most recent Visualizzazione «classica» dei risultati Verificare i Search details, soprattutto per le traduzioni nei MeSH Similar articles A partire da una singola citazione Tenere in considerazione in particolare le reviews
La conduzione di una ricerca: la ricerca avanzata Costruzione della ricerca con la «logica dei mattoni Lego®» Ogni mattone una parola chiave Ogni parola chiave può essere cercata in un campo specifico (Title word, abstract, subject)che nella conduzione della ricerca si traduce in un marcatore (tag) Il legante sono gli operatori booleani Visualizzazione e riutilizzo della Cronologia (Search history) Replica di una ricerca (sessione di 8 ore, max 100 ricerche memorizzate, cronologia di 6 mesi con login a MyNCBI) Combinazione di più ricerche (operatori booleani) Salvataggio di una o più ricerche in MyNCBI
Massimo Urbini ABIS – Settore Biblioteca di Medicina Biblioteca Clinica F.B. Bianchi massimo.urbini@unibo.it 051 2087377 https://sba.unibo.it/it
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