CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina

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CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina
Augusto Pessina
   Dipartimento Scienze Biomediche, Chirurgiche e Odontoiatriche
                  Università degli Studi di Milano

   CELLULE STAMINALI E
PROBLEMATICHE CORRELATE

               Università Cattolica Sacro Cuore
                      28 Febbraio 2013

                  Augusto Pessina,2013
CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina
Induced Pluripotent Stem Cells(iPSc)
                 NOBEL PRIZE 2012

Ci sono alternative agli embrioni?
Cosa sono le IPSc
Quali problemi pongono?
Una nota antropologica
                     Augusto Pessina,2013
CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina
ALTERNATIVES TO EMBRYO
               Do they exist? Are they ethical?
•Amniotic fluid ( De Coppi)

•Placenta (Parolini ; Heustschleger, Vien,De Coppi )

•Pluripotent spermatogonial stem cells in testis of neonatal and adult mice
(Shinohara 2004; Guan 2006 ( Multipotent ? Seandel 2007)

•2006 Robert Lanza : basta un blastomero per ottenere cellule pluripotenti (si
ma… l’embrione muore??)

•Bovine oocyte extract , Artificial cytoplast ( EDI et al…)

                               PARTHENOGENESIS
•Stimulation of monkey oocytes >>Blastocyst >>cyno-1 (?) >> neural cells and
epithelial cells, cardiomyocytes(Vrana et al, Pnas 2003).
•Activation of human oocytes to blastocystis (Brevini et al.,2005)
•Healthy mice ( 2 /371 tries) from paired mature-immature oocytes donor
immature oocyte with a knockout of imprinting control region on chr 7 (
Kawahara M et al, Nature 2007) Augusto Pessina,2013
CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina
PREMI NOBEL PER LA FISIOLOGIA
   E LA MEDICINA 2012

                                44 anni = l’età di Yamanaka

                                                             Yamanaka, S. (2006). Induction
Gurdon, J.B. (1962).
                                                             of pluripotent stem cells from
The developmental capacity of nuclei
                                                             mouse embryonic and adult
taken from intestinal epithelium cells                       fibroblast cultures by defined
of feeding tadpoles.                                         factors. Cell 126:663-676.
Journal of Embryology and Experimental Morphology
10:622-640.
                                      Augusto Pessina,2013
CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina
Augusto Pessina,2013
CELLULE STAMINALI E PROBLEMATICHE CORRELATE - Augusto Pessina
CLONAZIONE DI J.B. GURDON ,1962

Xenopus laevis

   Augusto Pessina,2013
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CLONAZIONE DI WILMUT , 1997
             ( Dolly)

Augusto Pessina,2013
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Dolly viva   Augusto Pessina,2013
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Dolly morta

Augusto Pessina,2013
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Augusto Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
A: retro/ lentivirus
                         transduction

                        B: adenovirus
                        transduction

                       C: plasmid
                       tarnsfection

                       D: transposone
                       based transfection

Augusto Pessina,2013
Molecular Vision 2010; 16:768-773 
Received 2 January 2010 | Accepted 21 April 2010 | Published 28 April 2010
Figure 1. Identification of a c.70del20 mutation in a patient with unilateral
microphthalmia. A: Photograph of Patient 1 with SOX2anophthalmia syndrome.
Note right microphthalmia (prosthesis in place) and prominent ears.
B: Sequence fragments showing the c.70del20 region in the patient (p), his mother (m)
and his father (f). The position of the deletion is indicated with a red arrow. Note

normal SOX2sequence in the patient’s parents
                                Augusto       consistent with their unaffected status.
                                        Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
A scheme of the generation of induced pluripotent stem (iPS) cells.

1.   Isolate and culture donor cells.

2.   Transfect stem cell-associated genes into the cells by viral vectors.

3.   Harvest and culture the cells according to ES cell culture, using
     feeder cells
     (lightgray).

4.   A small subset of the transfected cells become iPS cells and generate
     ES-like colonies

                             Augusto Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
Augusto Pessina,2013
The most stringent method to evaluate                  A less stringent method to assess
the pluripotency of iPSCs is to inject                 the pluripotency of iPSCs is
the ES cells into host blastocysts to                  teratoma formation assay.
assay if viable chimeras are produced .               In this assay, iPSCs injected under the
By using an appropriate reporter system or cell       skin of nude mice should develop
markers, cells from the iPSC lineage can be           teratomas with the distinct structure of all
traced throughout the whole body of chimeric          three germ layers (ectoderm, mesoderm,
mice. However, chimera formation is not a             and endoderm). The teratoma assay
practical approach for human cells, nor even for      requires a threshold level of cells to prove
mouse cells, as this is time-consuming and not        successful, though the exact number has
applicable to most research laboratoriesAugusto Pessina,2013
                                                      not yet been identified.
.
The more frequently used method for assessing the pluripotency of
iPSCs is to differentiate in vitro the putative iPSCs into various cell
types and assay for cell markers
These include gene expression markers, antigen markers, and epigenetic markers (DNA methylation and
histone modification patterns). For human iPSCs, frequently used stem cell expression markers are AP1,
Nanog, SSEA-3, SSEA-4, TRA-1-60, TRA-1-81, and TRA-2-49/6E. For mouse iPSCs, AP1, Nanog, and
SSEA-1 are often used. Human and mouse iPSCs have been differentiated in vitro into neural stem cells,
neurons, cardiomyocytes, etc. Specific expression and antigen markers are available for each of these cell
types.

                                             Augusto Pessina,2013
Aberrant silencing of imprinted genes on chromosome
                                    12qF1 in mouse induced pluripotent stem cells. Stadtfeld
                                    M, Apostolou E, Akutsu H, Fukuda A, Follett P, Natesan
                                    S, Kono T, Shioda T, Hochedlinger K. Nature. 2010 May
                                    13;465(7295):175-81. Epub 2010 Apr25

Induced pluripotent stem cells (iPSCs) have been generated by enforced expression of defined sets
of transcription factors in somatic cells. It remains controversial whether iPSCs are molecularly and
functionally equivalent to blastocyst-derived embryonic stem (ES) cells. By comparing genetically
identical mouse ES cells and iPSCs, we show here that their overall messenger RNA and microRNA
expression patterns are indistinguishable with the exception of a few transcripts encoded within the
imprinted Dlk1-Dio3 gene cluster on chromosome 12qF1, which were aberrantly silenced in most of
the iPSC clones. Consistent with a developmental role of the Dlk1-Dio3 gene cluster, these iPSC
clones contributed poorly to chimaeras and failed to support the development of entirely iPSC-derived
animals ('all-iPSC mice').
In contrast, iPSC clones with normal expression of the Dlk1-Dio3 cluster
contributed to high-grade chimaeras and generated viable all-iPSC mice. Notably,
treatment of an iPSC clone that had silenced Dlk1-Dio3 with a histone deacetylase inhibitor
reactivated the locus and rescued its ability to support full-term development of all-iPSC mice.
Thus, the expression state of a single imprinted gene cluster seems to distinguish
most murine iPSCs from ES cells and allows for the prospective identification of
iPSC clones that have the full development     potential of ES cells.
                                   Augusto Pessina,2013
I PROBLEMI BIOLOGICI DELLE IPSc
( MOLTO SIMILI A QUELLI DELLE CELLULE EMBRIONALI)

Genomic instability in iPS: time for a break
M.A Blasco et al, The EMBO Journal (2011) 30, 991 - 993
• Recent works have revealed that transcriptional and epigenetic
  reprogramming is often incomplete, which has raised some concerns on the
  nature of iPS.
• Inevitably, now the genome itself of iPS has been scrutinized; and the
  reports come with an unexpected twist: the presence of mutations in the
Stem  cells:
  genome       The dark side of induced pluripotency
           of iPS.
Martin F. Pera, Nature,471:46–47,2011
Induce pluripotent stem cells have great therapeutic potential. But genomic and
epigenomic analyses of these cells generated using current technology reveal
abnormalities that may affect their safe use.
Induced Pluripotency and Oncogenic Transformation Are Related
Processes
Riggs et al.Stem Cell Dev. 2012 Oct 26. [Epub ahead of print]
Taken together, these findings support a model in which OF and iPSCs are
related, yet distinct cell types, and in which induced pluripotency and induced
tumorigenesis are similar processes Augusto Pessina,2013
Genomic instability in iPS: time for a break
                  M.A Blasco et al, The EMBO Journal (2011) 30, 991 - 993

• Recent works have revealed that transcriptional and epigenetic
  reprogramming is often incomplete, which has raised some concerns on the
  nature of iPS.
• Inevitably, now the genome itself of iPS has been scrutinized; and the
  reports come with an unexpected twist: the presence of mutations in the
  genome of iPS.

           Stem cells: The dark side of induced pluripotency
                                      Martin F. Pera, Nature,471:46–47,2011
   Induced pluripotent stem cells have great therapeutic potential. But
   genomic and epigenomic analyses of these cells generated using current
   technology reveal abnormalities that may affect their safe use.

Induced Pluripotency and Oncogenic Transformation Are Related
Processes
Riggs JW, Barrilleaux BL, Varlakhanova N, Bush KM, Chan V, Knoepfler PS. Stem Cells Dev. 2012 Oct 26. [Epub ahead of print]

Taken together, these findings support a model in which OF and iPSCs are related,
yet distinct cell types, and in which induced pluripotency and induced
tumorigenesis are similar processesAugusto Pessina,2013
Copy number variation and selection during
     reprogramming to pluripotency
           (S.M Hussein et al, Nature,471:58–62 ,2011)

The mechanisms underlying the low efficiency of
reprogramming somatic cells into induced pluripotent
stem (iPS) cells are poorly understood.

There is a clear need to study whether the
reprogramming process itself compromises genomic
integrity and, through this, the efficiency of iPS cell
establishment.

Remarkably, expansion of human iPS cells in culture
selects rapidly against mutated cells, driving the lines
towards a genetic state resembling human ES cells.

                      Augusto Pessina,2013
iPSC
       Problemi di natura etica,legale ,sociale

-La privacy
-Il consenso
-I diritti del donatore
-La proprietà intellettuale
-Uso etico delle ips
-Traslazione clinica
Reference: Zarzeczny et al., iPS Cells: Mapping the Policy
Issues . Cell, 139:1032.1037.

                        Augusto Pessina,2013
Privacy
• Il fingerprint del DNA contiene informazioni sul donatore
  ,un uso inappropriato può violare la privacy individuale

• De-identificare/ anonimizzare i risultati è una soluzione?
- futuri usi clinici potrebbero rendere necessarie
  informazioni sullo stato di salute del donatore
- le tecnologie “single nucleotide polymorphisms” possono
  identificare il donatore

• Che fare di dati inattesi di cui si viene a conoscenza
  durante la ricerca? (es. predisposizioni genetiche del
  donatore a patologie specifiche).
                         Augusto Pessina,2013
Interrogativi circa il consenso
• Un consenso generico (per ricerche biologiche o banking)
  non è accettabile
• Occorre enumerare rigorosamente le ricerche e gli usi cui
  il consenso è riferito ( come includere i dati e l’uso non
  prevedibile a priori?).
• Occorre un consenso per ogni nuovo progetto di ricerca?
  (Es.: derivazione di gameti,produzione di chimere umane-
  animali,ricerche sulla fertilità ,ricerche di base , trapianti e
  altri usi clinici ,ecc….)
• Possono i genitori decidere per la donazione di cellule di
  un figlio?
• Se perdura il diritto del donatore all’informazione su dati
  che lo riguardano deve durare il diritto al ritiro del
  consenso dato?
• Fino a quando un donatore può ritirare il consenso dato?
  Si deve prevedere il diritto     di distruzione su richiesta del
                            Augusto Pessina,2013
  donatore dopo che una linea iPS è creata?
DIRITTI DEL DONATORE

• Il donatore ha diritto a benefici finanziari per l’uso
  commerciale di una linea di sue cellule? (negli USA i
  tribunali hanno rigettato tale richiesta per “public policy
  reasons”)
• Il diritto di autonomia e dignità del donatore deve
  riguardare il suo genoma? e quindi le informazioni
  sulla sua salute individuale possono essere
  utilizzate?
• Una linea cellulare manipolata è da considerare
  un prodotto nuovo o no ? ( dal momento che ha
  una certa quantità di caratteri unici del donatore?
                         Augusto Pessina,2013
Proprietà intellettuale
• Cosa si può brevettare ? La linea cellulare o la
  procedura per ottenerla o il suo utilizzo ? (Negli
  USA le strategie di brevetto sono alquanto aggressive. In
  Europa sono più restrittive se riguardano la distruzione di
  embrioni )
• Ogni tecnica di riprogrammazione è di per sé una
  nuova procedura brevettabile?
• La proliferazione dei brevetti pluri-patents (con più
  propreitari ) non può complicare e rendere
  costoso la negoziazione di tecnologie e diminuire
  la ricaduta dei benefici sociali e personali?
                        Augusto Pessina,2013
USO ETICO DI iPS cells
• La questione cruciale :le iPS sono equivalenti delle hESC ?
  Per rispondere a questa domanda si rende necessario
  sperimentare su cellule embrionali umane!
• La tecnica di “tetraploid complementation” potrebbe
  permettere la clonazione umana (con iPS introdotte in una
  blastocisti tetraploide si genera un animale geneticamente
  identico al donatore della cellula somatica anche per il
  DNA dei mitocondri!!)
• L’uso a scopi riproduttivi (derivazione di gameti) pone
  gravi questioni etiche sia in relazione al consenso che alla
  sicurezza e introduce alla possibilità di clonazione
• La funzionalità di gameti derivati in vitro dovrà
  necessariamente essere verificata mediante la produzione
  e la conseguente distruzione di embrioni .

                         Augusto Pessina,2013
Nature 461, 86-90 (3 September 2009) | doi:10.1038/nature08267; Published online 23 July 2009
       iPS cells produce viable mice through tetraploid complementation
 Xiao-yang Zhao1,2,5, Wei Li1,2,5, Zhuo Lv1,2,5, Lei Liu1, Man Tong1,2, Tang Hai1, Jie Hao1,2, Chang-long Guo1,2, Qing-wen Ma3,
                                              Liu Wang1, Fanyi Zeng3,4 & Qi Zhou1                                        Nature Genetics

(a) IVF in the mouse (control).
(b) Tetraploid
    complementation:
    electrofusion of two-cell
    embryo (4N) followed by
    culture to blastocyst stage
    and injection of ESCs (2N)
    derived from fertilized
    embryos (fESCs). The
    resulting pup is 2N; the
    placenta is 4
(c) Tetraploid complementation
    with injection of ntESCs,
    showing similar efficiency
    to fESCs.
(d) Nuclear transfer results in
    only 1%–2% term
    development; most have
    large placentas (98%–99%
    die in utero).

                                                   Augusto Pessina,2013
Translazione clinica

• Per poter utilizzare ips in terapia sarà necessario passare
  attraverso modelli animali aprendo altri problemi etici
  come la produzione di chimere uomo-animale.
• Le prospettive sembrano assai complesse. Occorre la
  messa a punto di standards di riferimento che siano
  accettabili
• Le agenzie regolatorie possono applicare i criteri già usati
  per altri prodotti cellulari? Ogni nuova linea iPS è da
  considerare un prodotto individuale nuovo e quindi non
  assimilabile ad altri?
• Sembra improbabile che i processi standardizzati e
  approvati per alcune cellule staminali possano essere
  applicati anche alle iPS.!
                          Augusto Pessina,2013
Inoltre
• La forte pressione commerciale suscitata dalle iPS
  rappresenta oggi un impedimento pratico alla condivisione
  di criteri standardizzati per la loro produzione
• Ancor più grave se si pensa agli aspetti terapeutici.
• Un esempio dagli USA:
• Trials clinici in lesioni al midollo spinale eseguiti dalla
  Geron con progenitori oligodendrocitici derivati da hESC
• …i dati sulla efficacia, sulla sicurezza e sulle procedure di
  produzione restano confidenziali tra la Ditta e la FDA.
• Nessuno può imparare da questi studi che sono destinati
  ad essere ripetuti con ulteriore dispendio di risorse e di
  embrioni umani.

                         Augusto Pessina,2013
Ringraziamenti a
                      ARIANNA BONOMI
                     VALENTINA COCCE’
                      FRANCESCA SISTO
                    LOREDANA CAVICCHINI

             LABORATORIO COLTURE CELLULARI
Dipartimento di Scienze Biomediche,Chirurgiche e Odontoiatriche
                 Università degli Studi di Milano
                         Augusto Pessina,2013
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