INIZIATIVA DI INFORMAZIONE SU ATTIVITÀ DI SCREENING PER SARS-COV-2 NEI LUOGHI DI LAVORO ATTRAVERSO TEST ANTIGENICI RAPIDI - AUSL Reggio Emilia

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INIZIATIVA DI INFORMAZIONE SU ATTIVITÀ DI SCREENING PER SARS-COV-2 NEI LUOGHI DI LAVORO ATTRAVERSO TEST ANTIGENICI RAPIDI - AUSL Reggio Emilia
INIZIATIVA DI INFORMAZIONE SU
       ATTIVITÀ DI SCREENING PER
  SARS-COV-2 NEI LUOGHI DI LAVORO
ATTRAVERSO TEST ANTIGENICI RAPIDI
 Indicazioni operative per l’effettuazione di
     test di laboratorio per SARS-CoV-2
   Attività di screening nei luoghi di lavoro attraverso
             test antigenici rapidi nasofaringei
   Dr. Matteo RICCO’ - AUSL-IRCCS di Reggio Emilia
                   matteo.ricco@ausl.re.it
                  24. Febbraio 2021 – WEBINAR
                         h 16.00 – 18.00
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Considerazioni per l’uso dei test
diagnostici.
• Necessità di garantire test in tempi compatibili con le diverse
  esigenze di salute pubblica.
• L’elevata sensibilità e specificità non possono rappresentare
  l’unico criterio nella scelta del tipo di test all’interno di una
  attività di sorveglianza che sia sostenibile.
• Critica è anche la raccolta dati relativamente ai test eseguiti
  con la conseguente possibilità di analisi e valutazione delle
  strategie adottate piuttosto che della diffusione della infezione.

Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
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Strategie d’uso.
Indicazioni e considerazioni generali.
• L’analisi diagnostica può essere effettuata solo presso laboratori,
  altamente specializzati, di riferimento regionali e laboratori aggiuntivi
  individuati dalle Regioni.
• I dati relativi ai test da qualsiasi soggetto vengano eseguiti devono essere
  riportati al Dipartimento di Prevenzione (DdP).
• Sebbene i test molecolari siano quelli di riferimento per sensibilità e
  specificità, in molte circostanze si può ricorrere ai test antigenici rapidi che,
  oltre essere meno laboriosi e costosi, possono fornire i risultati in meno di
  mezz’ora e sono eseguibili anche in modo delocalizzato e consentono se
  c’è link epidemiologico di accelerare le misure previste.

Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
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Test disponibili per rilevare
l’infezione da SARS-CoV-2
(1) test che evidenziano la presenza di materiale genetico
(RNA) del virus (test molecolari o PCR).
(2) test che evidenziano la presenza di componenti (antigeni)
del virus (test antigenici).
(3) test che evidenziano la presenza di anticorpi contro il virus
(test sierologici tradizionali o rapidi - POCT). Tali test rilevano
l’avvenuta esposizione al virus e, solo in alcuni casi, sono in
grado di rilevare la presenza di un’infezione in atto (individui con
malattia lieve o moderata i cui sintomi siano iniziati almeno una
settimana prima).

Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
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Test molecolare mediante tampone

    • È attualmente il test più affidabile, di riferimento per la diagnosi di infezione
      da coronavirus. Evidenzia la presenza di materiale genetico (RNA) del
      virus (test molecolare o PCR).
    • La rilevazione dell’RNA virale di SARS-CoV-2 eseguita in laboratorio da
      campioni clinici (in genere tamponi nasofaringei o orofaringei) ad oggi
      rimane il saggio di riferimento internazionale per sensibilità e
      specificità ed è in grado di rilevare il patogeno anche a bassa carica
      virale in soggetti sintomatici, presintomatici o asintomatici.
    • L’analisi può essere effettuata solo in laboratori altamente
      specializzati con operatori esperti, individuati dalle autorità sanitarie

Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
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Test molecolare mediante tampone
                                                           Attenzione però. Lo stesso
                                                            campione nasofaringeo
                                                          rappresenta una metodica di
                                                         sampling non ottimale dopo 5
                                                         giorni dall’inizio dei sintomi
                                                         per via della storia naturale di
                                                                 SARS-CoV-2.
                                                   RT-qPCR positivity peaked to 93% in
                                                    bronchoalveolar lavage specimens,
                                                  dropping to 72% in sputum, and 63% in
                                                 nasal swabs, with only a 32% positivity in
                                                            pharyngeal swabs
                                                        (Wang et al. JAMA 2020 doi:
Zou et al. NEJM 2020 doi: 10.1056/NEJMc2001737           10.1001/jama.2020.1585).
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Test antigenico rapido (mediante
    tampone nasale, naso-orofaringeo)
    • Analogamente ai test molecolari, i saggi antigenici sono di tipo
      diretto, ossia valutano direttamente la presenza del virus nel
      campione clinico.
    • I test antigenici rapidi sono di tipo qualitativo (si/no) e
      intercettano, nei campioni respiratori, tramite anticorpi
      policlonali o monoclonali, specifici peptidi (porzioni
      proteiche) della proteina S («spike») o N (nucleocapside)
      presenti sulla superficie virale di SARS-CoV-2.
        (nb. Quasi tutti I test sul mercato intercettano la proteina S derivata da modello di Wuhan 2019)

Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
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Test antigenico rapido (mediante
    tampone nasale, naso-orofaringeo)
    • Le modalità di raccolta dei tamponi sono simili a quelle dei test
      molecolari (tampone naso-faringeo), i tempi di risposta sono
      molto brevi (circa 15 minuti), ma la sensibilità e specificità di
      questo test sembrano essere inferiori a quelle dei test
      molecolari.
    • Considerando la possibilità di risultati falso-positivi, i risultati
      positivi ai test antigenici devono essere confermati con il test
      molecolare. Questi test sono potenzialmente utili
      soprattutto per le indagini di screening.

Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
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Riccò et al. J Infection 2021 (in press) doi: 10.1016/j.jinf.2021.01.011
   Nell’esperienza del TAA, i test rapidi si sono dimostrati utili ad
 accelerare il rallentamento di un «burst» epidemico, ma di fatto non
possono da soli risolvere il problema (a livello locale; interazione con
                               altre aree)
Test antigenico rapido
    (mediante tampone salivare)
    • Sono poi disponibili test che utilizzano come campione da
      analizzare la saliva, il cui prelievo risulta più semplice e meno
      invasivo rispetto al tampone naso-faringeo, e pertanto
      potenzialmente utili per screening di grandi numeri di persone.
    • Anche per i test salivari esistono test di tipo molecolare (che
      rilevano cioè la presenza nel campione dell’RNA del virus) e di
      tipo antigenico (che rilevano nel campione le proteine virali). Al
      momento richiedono per l’utilizzo un laboratorio attrezzato.
        In altre parole, risolvono il problema del personale che raccoglie il
               campione ma non quello delle modalità di elaborazione
Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
Test sierologici

    • I test sierologici identificano l’esposizione al virus SARS-COV- 2
      attraverso la rilevazione di eventuali anticorpi diretti contro
      SARS-CoV-2 ma non sono in grado di confermare o meno
      una infezione in atto. Per questo, in caso di positività,
      necessitano di un test molecolare su tampone per conferma.
    • I test sierologici sono utili nella ricerca e nella valutazione
      epidemiologica della circolazione virale e non possono essere
      considerati come strumenti diagnostici sostitutivi del test
      molecolare.

Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
Test sierologici:
il problema del periodo finestra

                                      NELLA PRIMA SETTIMANA il rischio di
                                      rilevare dei falsi negativi supera il 20%
                                      e raggiunge il 50%

                Lassauniere R et al. medRxiv doi: 10.1101/2020.04.09.20056325
TEST MOLECOLARE                      TEST ANTIGENICO                  TEST ANTICORPALE POCT
Conosciuto anche come…           Test diagnostico, RT-qPCR ...                Test rapido                         Test sierologico

                                                                                                                                                https://www.fda.gov/media/140161/download modificata
Cosa cerca?                        Materiale genetico virale                 Proteine virali              Anticorpi prodotti contro il virus

Come si preleva il campione?        Tampone nasofaringeo               Tampone nasofaringeo                      Sangue periferico
                                        Test salivare                    Tampone nasale
Serve personale specializzato?                 SI                       Tampone nasale: NO                               NO
                                                                      Tampone nasorangeo: SI
Quanto serve per processare il   Test di massa: 90 minuti circa      Di solito, meno di 30 minuti           Di solito, meno di 30 minuti
campione?                        Test rapidi: meno di 60 minuti
Servono macchinari                             SI                  In genere NO. Possono essere           In genere NO. Possono essere
specializzati?                                                          usati per amplificare e                usati per amplificare e
                                                                       standardizzare la lettura.             standardizzare la lettura.
Quanto serve per avere i          Qualche giorno, fino ad una        Di solito, meno di 30 minuti           Di solito, meno di 30 minuti
risultati?                       settimana (in alcune situazioni
                                          particolari)
Ha bisogno di un test di                      No.                  Falsi positivi possibili in caso di    Falsi positivi possibili in caso di
conferma?                                                             bassa circolazione virale.             bassa circolazione virale.
                                                                   Falsi negativi possibili in caso di   Falsi negativi possibili in caso di
                                                                        alta circolazione virale.             alta circolazione virale.
                                                                                                         Può essere necessario ripetere il
                                                                                                               test (periodo finestra)

Cosa mostra?                           Infezioni in corso                  Infezioni in corso            Precedente contatto con il virus
In conclusione

      • il test molecolare rimane tuttora il test di riferimento per la diagnosi
        di SARS-CoV-2;
      • i test antigenici rapidi su tampone naso-faringeo possono essere utili
        in determinati contesti, come lo screening rapido di numerose
        persone;
      • i test antigenici e molecolari su campioni di saliva, allo stato attuale
        delle conoscenze, difficilmente si prestano allo screening rapido di
        numerose persone, in quanto richiedono un laboratorio attrezzato.

Ministero della salute. «Uso dei test antigenici rapidi per la diagnosi di infezione da SARS-CoV-2, con particolare riguardo al contesto scolastico». 29/09/2020
Ma quali sono le performances sul campo?
       Test anticorpali rapidi (POCT)
          Test molecolari su saliva
               Test antigenici
Test anticorpali rapidi
                   (POCT)                                   Queste stime sono state condotte
                                                              nel mese di MAGGIO 2020

                                                   Property               Value                95%CI
                                                Sensitivity (%)            64.8              54.5; 74.0
                                                Specificity (%)            98.0              95.8; 99.0
                                                      PLR                  14.2               8.7; 23.2
                                                      NLR                   0.4               0.2; 0.5
                                                      DOR                 51.01            25.26; 103.00
                                                Cohen’s kappa             0.594             0.496; 0.691

                                                 La “kappa” di Cohen esprime il grado di concordanza
                                                fra un test e quello di riferimento (il “gold standard”). In
                                                   generale, valori di Kappa al di sotto di 0.800 sono
                                                                  considerati “deboli”).

Riccò et al. JCM 2020 doi: 10.3390/jcm9051515
Test anticorpali rapidi
                      (POCT)
  Property                Value                  95%CI
Sensitivity (%)           76.3%                70.6 – 81.2
Specificity (%)           97.6%                96.3 – 98.5
    PLR                   15.420             11.594 - 20.509
    NLR                   0.233               0.187 - 0.290
    DOR                    74.2                50.4 - 109.3
Cohen’s kappa             0.642               0.596 – 0.688

Riccò et al. JCM 2021 (submitted)   (aggiornato al 10/02/2021))
Test molecolari su saliva
Property             Value              Heterogeneity
                    (95%CI)               (p value)
Sensitivity         80.4%                 I2 = 79%
   (%)            (53.9–90.1)            (p < 0.001)
Specificity         97.7%                 I2 = 74%
   (%)            (93.8–99.2)            (p < 0.001)
   NLR               0.203                I2 = 62%
                 (0.094; 0.436)          (p = 0.005)
   PLR               20.141               I2 = 73%
                 (8.207; 49.430)         (p < 0.001)
   DOR              110.562                I2 = 72%
               (32.720; 373.594)          p < 0.001)
 Cohen’s        0.75 (0.62; 0.88)         I2 = 96%
  Kappa                                  (p < 0.001)

Attenzione al discrimine della tempistica del test.
Test SINCRONI (i.e. test salivare e nasale nello
stesso tempo) hanno performances PEGGIORI.
                                                        Riccò M et al. Acta Biom 2020 doi: 10.23750/abm.v91i3.10020
Test antigenici rapidi

  Le performances complessive sono
        drasticamente abbattute
  dall’inserimento nelle stime di alcuni
                  studi.

                   In effetti…

 ICT = test immunocromatografico
 CIA = test a chemioluminescenza
 FIA = test ad immunofluorescenza
Riccò M et al. Acta Biom 2021; in press
Riccò M et al. Acta Biom 2021; in press
   I test antigenici sono direttamente influenzati da due parametri, uno dipendente dal test (i.e. la soglia di
detenzione: quante copie virali sono necessarie perché il test “viri positivo”) uno dipendente dal paziente (i.e. il
                   livello di attività dell’infezione al momento del test, cioè l’attività replicativa)
RIASSUMENDO…
 Variable     Estimate       95%CI           t2     P value           Q(df)            I2
Sensitivity     72.8        62.4; 81.3      1.582   < 0.001        831.62 (28)       96.5
 < 25 Ct        97.6        94.1; 99.0      1.953   < 0.001        102.07 (16)       80.0
 ≥ 25 Ct        43.6        27.6; 61.1      1.934   < 0.001        306.61 (16)       94.8
Specificity     99.4        99.0; 99.7      1.614   < 0.001        121.87 (28)       81.0
  Kappa        0.684       0.635; 0.733     0.018   < 0.001     809931.373 (28)      99.9
Accuracy       0.890       0.873; 0.907     0.002   < 0.001     100310.901 (28)      99.9
   DOR        288.394    153.206; 542.870   1.941   < 0.001       118.145 (28)       76.3
   NLR         0.230       0.169; 0.315     0.190   0.051          41.283 (28)       32.2
   PLR         61.687     38.586; 98.620    0.899   < 0.001        90.910 (28)       69.2
                                                     Riccò M et al. Acta Biom 2021; in press
Limite di detenzione nei test antigenici
                                           Limit of detection                     Adjusted LoD
          Assay             N. Tests     50% positive         95% positive        95% mean hit
                                           AgPOCT               AgPOCT                 rate
                                                                                  (copies/swab)
     Abbott Panbio™           105      5.61 (5.27; 5.95)     7.45 (6.79; 8.20)        6.55
   RapidGEN Biocredit          45      9.51 (8.84; 12.26)   11.10 (9.71; 17.01)       10.20
        Healgen®              105      4.48 (3.41; 5.32)     7.27 (6.27; 8.40)        6.37
     Coris Bioconcept         105      7.60 (7.37; 7.82)     8.36 (8.00; 8.76)        7.46
    R-Biopharm RIDA           105      7.19 (6.97; 7.43)     7.87 (7.52; 8.23)        6.97
NADAL COVID-19 Ag test        115      5.64 (5.28; 6.00)     7.68 (6.96; 8.50)        6.78

Corman VM et al. 2021 mdRxiv doi: 10.1101/2020.11.12.20230292
Limite di detenzione nei test antigenici
                                                          Limit of detection
             Assay                  N. Tests   50% positive AgPOCT        95% positive AgPOCT
           R Biopharm                  74          5.43 (5.00; 5.86)           7.42 (6.50; 8.48)
             Roche                     74          5.20 (4.90; 5.54)           6.56 (5.87; 7.24)
            LumirDx                    74          4.88 (4.58; 6.43)           7.26 (6.63; 7.94)
    NADAL COVID-19 Ag test             74         6.10 (5.79; 6.43)            7.26 (6.63; 7.94)

Kohmer N et al. 2021 JCM 2021; doi: 10.3390/jcm10020328
Test nei principali contesti.
Test sierologico.
Contesto                   Test di prima               Test alternativo         Commenti
                           scelta
Screening di               Test rapido                 Test sierologico         Il principale limite del test sierologico è la
comunità                   antigenico su               + conferma con           capacità di confermare o meno una infezione in
                           tampone oro-naso            test molecolare          atto a causa (risposta anticorpale tempo-
(ricerca di persone        faringeo o nasale +         su tampone               dipendente, scarso valore predittivo positivo dei
con infezione in atto                                  oro/naso                 test) nelle prime fasi della malattia.
in un gruppo esteso conferma con test                  faringeo per i
di persone)           molecolare su                    casi positivi (*)        Per questo necessita in caso di positività di un test
                      tampone oro/naso                                          molecolare su tampone per conferma. Pertanto, la
per motivi di         faringeo per i casi                                       strategia d’uso del test sierologico in questo
sanità pubblica       positivi in assenza                                       contesto è in via di valutazione.
                      di link
                      epidemiologico

Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
Test nei principali contesti.
Test rapido antigenico.
     Contesto                 Test di prima                   Test                                      Commenti
                                 scelta                   alternativo
  Screening di                 Test rapido                    Test                Esecuzione e risultato in un tempo minore
   comunità                  antigenico su               sierologico +                      dei test molecolari.
                              tampone oro-              conferma con
     (ricerca di             naso faringeo o                  test               Nell’ambito della strategia di comunità dove
   persone con                  nasale +                molecolare su             necessita avere rapidamente, a seguito di
 infezione in atto                                         tampone               positività, la possibilità di isolare il soggetto
   in un gruppo              conferma con                  oro/naso               ed intercettare rapidamente tutti i possibili
      esteso di             test molecolare              faringeo per i          contatti non è necessario confermare il test
      persone)                su tampone                casi positivi (*)          rapido antigenico con il test di biologia
                           oro/naso faringeo                                                       molecolare.
 per motivi di              per i casi positivi
sanità pubblica            in assenza di link
                           epidemiologico
Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
Test nei principali contesti.
Test rapido antigenico.
Contesto                       Test di prima           Test alternativo Commenti
                               scelta
Soggetto pauci-                Test rapido             Test molecolare      In caso di contact tracing il test antigenico rapido può
sintomatico in assenza di      antigenico su           su tampone           essere uno strumento strategico e sostenibile rispetto ai
link epidemiologico.           tampone oro-naso        oro-naso             test molecolari tradizionali qualora le capacità
                               faringeo o nasale       faringeo             diagnostiche di test molecolari siano già saturate.
Contatto stretto di caso       senza conferma                               La rapidità del risultato permette un veloce monitoraggio
confermato (incluso in         con test                                     di eventuali contagi e il conseguente isolamento del
ambiente scolastico o          molecolare su                                soggetto limitando la diffusione dell’infezione in
lavorativo) che è              tampone                                      ambiente comunitario.
asintomatico senza             oro/naso faringeo                            In questo caso, il rischio di risultati falsi negativi può
conviventi che siano           per i casi positivi                          essere accettabile in quanto bilanciato dalla velocità di
fragili o non collaboranti.                                                 risposta nel percorso di controllo delle infezioni e dalla
                                                                            possibilità di ripetere il test se ritenuto opportuno. Si
Soggetto asintomatico                                                       attendono maggiori dati sull’uso di questo test in soggetti
proveniente da paese a                                                      asintomatici per i quali questi test non sono stati finora
rischio come da DPCM                                                        indicati.
Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
Test nei principali contesti.
Test rapido antigenico.
Contesto                                 Test di prima         Test alternativo      Commenti
                                         scelta
Asintomatico che effettua il test    Test rapido               Test molecolare Effettuazione del test sulla base dell’organizzazione
su base volontaria,                  antigenico su             su tampone        regionale (a pagamento o inclusa in programmi di
                                     tampone oro-              oro/naso          sanità pubblica).
esame richiesto per motivi di        naso faringeo o           faringeo o nasale
lavoro o di viaggio (fatte salve     nasale +
specifiche prescrizioni dei paesi di conferma con
destinazione che possano             test molecolare
prevedere specificatamente test      su tampone
molecolare) o per                    oro/naso
                                     faringeo per i
richieste non correlate a            casi positivi
esigenze cliniche o di salute
pubblica ricadenti nei casi
precedenti ecc.

Ministero della salute e ISS. «Test di laboratorio per SARS-CoV-2 e loro uso di sanità pubblica». 23/10/2020 (Ministero della salute 30/10/2020)
Test nei principali contesti.
Test molecolare

   Caso sospetto sintomatico con o senza link epidemiologico

   Soggetto in quarantena se compare sintomatologia (es. contatto stretto di caso confermato)

   Contatto stretto di caso confermato che vive o frequenta regolarmente soggetti fragili a rischio
   di complicanze o soggetti non collaboranti

   Asintomatico per ricovero programmato, ingresso in larghe comunità chiuse laddove previsto
   (es. RSA, prigioni, strutture per soggetti con disabilità mentale, altro)

   Screening degli operatori sanitari/personale in contesti ad alto rischio

   Soggetto in isolamento per la conferma di guarigione

   Test molecolare su tampone oro-naso faringeo
Laboratori e medici competenti.
    Test rapidi antigenici.
Di consentire ai laboratori autorizzati ad eseguire i test molecolari
ai sensi della presente determinazione, ai medici competenti e ai
laboratori privati autorizzati all’effettuazione dei test sierologici di
cui alle DGR n. 350/2020 e n. 475/2020, nonché ai soggetti
individuati dai soggetti datoriali firmatari del Patto per il lavoro
che intendano realizzare un percorso di screening, tramite i
medici competenti, di effettuare i test rapidi antigenici a condizione
che utilizzino test conformi alla legislazione europea e nazionale
vigente e che trasmettano preventivamente alla Direzione generale
Cura della persona, salute e welfare l’attestazione di avvenuto
collaudo da parte di Lepida S.c.p.a. (Punto 9)
Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del
                                                                05/11/2020.
Laboratori e medici competenti.
    Test Molecolari.
    • Di consentire il prelievo per l’esecuzione del tampone
      nasofaringeo anche presso le strutture sanitarie che siano
      autorizzate all’effettuazione dei test sierologici di cui alle DGR
      n. 350/2020 e n. 475/2020 che si siano rese disponibili a tale
      attività.
    • Queste strutture, qualora non siano in possesso di specifica
      autorizzazione, debbono avvalersi per la diagnosi molecolare
      di uno dei laboratori della Rete regionale o nazionale.
      (Punto 10)

Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
Laboratori e medici competenti.
    Test rapidi antigenici e DSP
    Di stabilire inoltre che a fronte di risultato positivo di test
    rapido antigenico il Direttore sanitario del laboratorio
    debba farsi carico di informare la competente
    articolazione del Dipartimento di Sanità Pubblica in
    merito alla necessità di eseguire il test molecolare su
    tampone naso-faringeo da parte del cittadino o in merito
    ai risultati del test molecolare stesso nel caso il cittadino
    ritenga di eseguirlo a proprio carico presso il laboratorio,
    se autorizzato. (Punto14)
Regione Emilia-Romagna. «Indicazioni operative per l’effettuazione di test di laboratorio per SARS-CoV-2». Determinazione Num. 19468 del 05/11/2020.
PROBLEMA: l’epidemiologia dell’infezione
influenza la nostra capacità di “testare”
                   … But sensitivity for many available tests
                   appears to be substantially lower: the
                   studies cited above suggest that 70% is
                   probably a reasonable estimate. At this
                   sensitivity level, with a pretest probability
                   of 50%, the post-test probability with a
                   negative test would be 23% — far too
                   high to safely assume someone is
                   uninfected …
                   (Woloshin N et al. NEJM 2020 doi: 10.1056/NEJMp2015897)
Valore predittivo positivo e negativo in relazione alla prevalenza
 (sensibilità dell’80% e una specificità del 98% su una popolazione di 1000 persone con
 livelli di prevalenza crescenti)

Prevalenza Esempi
            A questo livello di prevalenza, la performance di un test negativo è ottima:
            nella quasi totalità dei casi identifica correttamente i veri negativi.
   1%
            Al contrario, un test positivo è poco informativo perché solo in 1/3 dei casi
            identifica correttamente persone realmente infette. In 2/3 si tratta di falsi positivi.
            Si riduce di poco il VPN (vengono ancora correttamente classificati il 99,6% dei
   2%       pazienti con test negativo).
            Aumenta il VPP ma è ancora molto basso (il 55% sono test falsamente positivi).

            Nell’1,1% dei test risultati negativi, il test è falsamente negativo. Nel 32% dei test
   5%
            positivi, il test è un falso positivo.

            Nel 2% dei test risultati negativi, il test è un falso negativo. Nel 18% dei test
  10 %
            risultati positivi, il test è un falso positivo.
Valore predittivo positivo e negativo in relazione alla prevalenza
 (sensibilità dell’80% e una specificità del 98% su una popolazione di 1000 persone con
 livelli di prevalenza crescenti)

Prevalenza Esempi

 In data 23 Febbraio 2021 in Emilia Romagna sono stati
                eseguiti 35,010 tamponi

              di questi, sono risultati positivi 1,588 casi
                                 4.5%
            Nell’1,1% dei test risultati negativi, il test è falsamente negativo. Nel 32% dei
   5%
            test positivi, il test è un falso positivo.

   Quindi per ora siamo più o meno QUI
Esempi di contesti caratterizzati da diversi livelli di
prevalenza attesa rispetto alla popolazione generale
Prevalenza          Esempi

                 Persone con sintomi compatibili e fattori di rischio (ad
    Alta > 10%   esempio operatori sanitari o socio-sanitari, contatti di
                 caso)
                 Persone sintomatiche senza particolari fattori di rischio
Intermedia 3-10% Contatti asintomatici di caso
                 Persone provenienti da paesi a rischio

                    Persone asintomatiche che accedono al PS
  Bassa ≤ 2 %
                    Ospiti CRA in assenza di casi in struttura
RICORDATE CHE BUONA PARTE DEI
E le varianti?            TEST DERIVANO DAI PRIMI STUDI
                              CINESI IN AREA WUHAN

                 Phylogenetic analysis of RDB sequence variants.
                 Variants are color colored according to the date of
                 isolation of the sequence.
                 Dumonteil E et al. Pathogens 2020, 9, 584; doi:10.3390/pathogens9070584

                       SARS-CoV-2 N antigen                          SARS-CoV-2 S antigen
RICORDATE CHE BUONA PARTE DEI
E le varianti?                        TEST DERIVANO DAI PRIMI STUDI
                                          CINESI IN AREA WUHAN
    CT value      Ag Positive, %      Ag. Negative, %
       < 20          3, 100%                  0, -
     20 – 25        21, 95.5%             1, 4.5%       Prevalence   PNV 91.9%
     25 – 30        42, 89.3%             5, 10.7%         21%       PPV 97.2%
     30 – 35        27, 64.3%            15, 35.7%
       > 35          8, 25.8%            23, 74.2%

  Sensitivity:   69.2%   (95%CI 61.4; 75.8)
  Specificity:   99.0%   (95%CI 98.8; 99.3)

Studio condotto in Sud Africa durante l’emersione della variante 501Y.v2
(“variante sudafricana”) Laguda Akingba O et al. 2021 doi:
10.1101/2021.02.03.21251057
Voysey M et al. Lancet 2021
                                            doi: 10.1016/ S0140-6736(20)32661-1

Le “varianti” sono “sorte” (emerse?) dove
sono in corso trial vaccinali.
Quindi dove sono in atto attività
laboratistiche di sequenziamento più
avanzate.
Sono probabilmente (al netto delle
specificità) un fenomeno diffuso sin
dai primordi della pandemia.
Indicazioni per l’utilizzo dei test antigenici rapidi

Contesto                               Prevalenza   Indicazioni

SCUOLE                                              Utilizzare il test antigenico rapido
                                       Intermedia
Screening in ambito scolastico in                   Se negativo: nessun intervento ulteriore
                                         Bassa      Se positivo: conferma con test molecolare RT-PCR. Se non fattibile
assenza di trasmissione intra-
scolastica già evidenziata                          eseguire il test antigenico a 10 giorni
                                                    Utilizzare il test antigenico rapido
AEROPORTI                                           Se negativo: nessun test di conferma
Persone asintomatiche provenienti      Intermedia   Se positivo: isolamento a domicilio per 10 giorni; rivalutazione se
da paesi a rischio                                  comparsa sintomi; preferibile confermare con PCR. Se non fattibile
                                                    esecuzione il test antigenico a 10 giorni
                                                    Utilizzare il test antigenico rapido; confermare i positivi con test
                                                    molecolare su tampone nasofaringeo.
                                                    Se il risultato del test antigenico è “indeterminato” eseguire il test PCR di
ALTRI CONTESTI                                      conferma. Non è necessario nel frattempo alcun provvedimento, a meno
Screening di comunità (ricerca di                   che non ci fossero motivi per i quali la persona era già stata posta in
persone con infezione in atto in un      Bassa      quarantena o se vi sia necessità di un suo ricovero in ospedale.
gruppo esteso di persone) per motivi                Gli ambiti dei quali si può fare ricorso ai test antigenici rapidi sono, ad
di sanità pubblica                                  esempio:
                                                    ambienti di lavoro attraverso i Medici competenti,
                                                    visitatori CRA ove l’accesso è autorizzato dal Direttore della struttura,
                                                    assistenti familiari che si prendono cura di persone anziane a domicilio,
Screening nei luoghi di lavoro attraverso
test antigenici rapidi nasofaringei
In Regione Emilia-Romagna
Screening con test antigenici rapidi
• Nell’ambito dell’interlocuzione per il Patto per il lavoro, la Regione
  Emilia-Romagna promuove uno screening collettivo dei lavoratori per la
  prevenzione del rischio di contagio da SARS-CoV-2.

• Lo scopo è quello di contenere l’epidemia e garantire la prosecuzione
  delle attività lavorative.

• Lo screening sarà effettuato dalle aziende mediante i medici competenti,
  con il coordinamento dei Servizi di Prevenzione e Sicurezza negli
  Ambienti di Lavoro dei Dipartimenti di Sanità Pubblica
Screening con test antigenici rapidi
Criteri di priorità
• Settore:                                         • Prossimità:
   •   trasporti e logistica                           • il lavoro in linea con distanza < 1 metro
   •   lavorazione carni                               • il lavoro con accentuata mobilità in reparto
   •   grande e media distribuzione organizzata          e possibili contatti interpersonali
   •   metalmeccanica                              • Aggregazione:
   •   alimentare e ortofrutta                         • un elevato turnover
   •   mobile imbottito                                • lavoro somministrato o stagionale
   •   assistenza domiciliare                          • appalti stabili (numero di appalti e numero
                                                         di lavoratori)
   •   aziende con attività in appalto in genere
                                                       • lavoratori provenienti da zone a maggior
                                                         rischio
                                                       • utilizzo comune di mezzi e strumenti
Screening con test antigenici rapidi

  Azienda trasmette
  richiesta a SPSAL

                           Medico competente
                                                          MC registra nel sistema
SPSAL consegna test al         effettua il test
                                                           informatico regionale             PSAL estrae i casi positivi
        MC                direttamente o tramite
                                                              (Portale SOLE)
                                 laboratorio

                                                                                               Test molecolare a cura
                         SPSAL collabora con MC                       Test                        della AUSL o di
                          per l’individuazione dei                 molecolare                 laboratorio privato con il
                                contatti stretti                    positivo                     coordinamento del
                                                                                                medico competente

                                        SPSAL effettua accesso                  ISP attiva le procedure
                                       per misure di prevenzione                        previste
Screening con test antigenici rapidi
  Azienda acquisisce
autonomamente i test e
                                                                    SPSAL estrae i casi
invia comunicazione a
                                                                        positivi
        SPSAL

                                     MC / laboratorio registra
  Medico competente /                nel sistema informatico                Test
  laboratorio incaricato                     regionale                   antigenico
      effettua il test                                                    positivo
                                         (Portale SOLE)

                                     MC / laboratorio registra
                                     nel sistema informatico       Test molecolare a cura
                                    regionale test molecolare       del laboratorio scelto
SPSAL collabora con MC                                                   dall’azienda
                                         (Portale SOLE)
 per l’individuazione dei
       contatti stretti

                                              Test
                                                                   ISP attiva le procedure
                                           molecolare
 SPSAL effettua accesso                                                    previste
                                            positivo
per misure di prevenzione
Ausl (ICT):
Profilazione medici competenti
Profilazione medici PSAL
Consultazione ed estrazione dati locali

RER (ICT):
Estrazione dati regionali
Cliccando su
      Trasmetti Esito
si apre la seguente scheda

Inserendo il CF
dell’assistito nel campo
Codice oppure
ricercando per Nome +
Cognome + Data di
nascita e cliccando sul
tasto Cerca cittadino il
sistema recupera
l’anagrafica
dall’Anagrafe Regionale
Inserire il numero di Telefono.
Poi il medico riporta se Presenza Febbre SI o NO e sceglie da Ambito Screening uno dei seguenti valori:
•          Scuola
•          AZIENDA
•          Altro
Ci raccomandiamo di compilare i dati dell’AZIENDA per ogni lavoratore
Il significato di casi di lavoratori positivi
• La presenza di più di un lavoratore contemporaneamente positivi in una
  stessa azienda può essere:
   • indicativa di una condizione di contagio avvenuto all’interno del luogo di lavoro;
   • riconducibile a contagi avvenuti al di fuori del lavoro in modo indipendente fra
     loro;
   • ricondotto a frequentazioni extra lavorative tra colleghi.
• Anche per i luoghi di lavoro sono rilevanti le caratteristiche
  epidemiologiche correlate allo stato di diffusività tra la popolazione in un
  dato territorio e in un dato momento.
• È rilevante ai fini della comprensione delle modalità di diffusione
  dell’epidemia considerare che il contagio può avvenire nella forma “da
  uno a uno” ma in particolari circostanze può avvenire anche nella forma
  “da uno a molti” dando origine a cluster di diffusione e anche a diffusione
  «da cluster a cluster».
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