Università degli Studi di Roma "Tor Vergata" Scheda Insegnamento/Attività Formativa
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Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”
Scheda Insegnamento/Attività Formativa
Docente responsabile dell’insegnamento/attività formativa
Nome Daniele
Cognome ARMENIA
Denominazione insegnamento/attività formativa
Italiano MICROBIOLOGIA AMBIENTALE
Inglese Environmental Microbiology
Informazioni insegnamento/attività formativa
A.A. 2019-2020
CdS LM Biologia Evoluzionistica, Ecologia e Antropologia Applicata
Codice 8066877
Canale unico
CFU 6
Obiettivi formativi e risultati di apprendimento attesi
OBIETTIVI FORMATIVI:
Il corso si propone di fornire allo studente gli strumenti necessari per comprendere le
nozioni di microbiologia generale legate alla struttura della cellula batterica, crescita e fattori
che la influenzano, diverse strategie metaboliche e processi di ricombinazione genica.
Unitamente agli argomenti di base, il corso prevede approfondimenti riguardanti lo studio
dei principali gruppi microbici ambientali, delle interazioni microrganismi/ambiente e delle
tecniche utilizzate in ecologia microbica. Il corso tratterà inoltre il corrente utilizzo dei
Italiano
microrganismi in applicazioni atte a ridurre i rischi per l'ambiente e la salute umana
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Gli studenti dovranno acquisire competenze teoriche e operative per la ricerca avanzata dei
processi e fenomeni dell'evoluzione microbiologica e delle problematiche relative, nonché
competenze sugli aspetti morfologico/funzionali, cellulari/molecolari, evoluzionistici, e
ecologico-ambientali dei batteri, funghi e virus di interesse ambientale.
Dovranno essere in grado di comprendere e eventualmente progettare procedure
sperimentali per tematiche di ricerca in microbiologia ambientale mediante l'utilizzo di
metodi filogenetici, statistici ed informatici applicati alla gestione dei dati sperimentali in
microbiologia ambientale, risanamento ambientale e sanità pubblica.
Tutte queste competenze sono ottenute tramite lezioni frontali inerenti sia argomenti teorici
che applicazioni dirette.
Mod. scheda Attività Formativa v.1.0
La verifica delle conoscenze e capacità di comprensione viene fatta tramite prova orale
finale.Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”
Scheda Insegnamento/Attività Formativa
LEARNING OUTCOMES:
The course aims to provide the student with the necessary tools to understand the notions
of general microbiology related to the structure of the bacterial cell, growth and factors that
affect it, different metabolic strategies and processes of gene recombination. Together with
the basic topics, the course includes in-depth studies concerning the understanding of the
main microbial environmental groups, the interactions between
Inglese microorganisms/environment and the techniques used in microbial ecology. The course will
also cover the current use of microorganisms in applications to reduce risks to the
environment and human health.
KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING:
Students should acquire theoretical and operational skills for advanced research on
processes and phenomena of microbiological evolution and related issues, as well as skills
on morphological/functional, cellular/molecular, evolutionary, and ecological-environmental
aspects of bacteria, fungi and viruses of environmental interest. They should be able to
understand and possibly design experimental procedures for research topics in
Prerequisiti environmental microbiology through the use of phylogenetic, statistical and computer
methods applied to the management of experimental data in concerning environmental
Si suggerisceand
remediation public health.diAll
la conoscenza thesedi
nozioni skills
base will
di be obtained
biologia, through
chimica ed lectures
ecologia.concerning
both theoretical and experimental topics.The knowledge and comprehension skills will be
be verified through a final oral test/interview.
Italiano
APPLYING KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING:
Acquisition of multidisciplinary application skills of methodological and technological type for
Testo
the fissoof:
execution 2 biological, microbiological and toxicological analyses; analyses and
controls related to the quality and hygiene of environment and food; biomolecular
methodologies.
Knowledge Students
of basic should
notions be able
of biology, to identify
chemistry theecology
and essential elements of microbiological
is suggested.
problems that can contribute to the modification of particular environmental events, using
Inglese their knowledge to monitoring the healthiness and quality of the environment or to take
advantage of the use of microbial species in bioremediation and / or public health.
MAKING JUDGEMENTS:
Upon completion of the course, students should:
Programma - be able to make autonomous interpretations and evaluations of microbiological analyses
of environmental interest;
- be able to carry out bibliographic research and to select the materials of interest, in
Tassonomiae
particular on the filogenesi
Web; dei microrganismi;i principali gruppi funzionali nei diversi phylum
evolutivi. I meccanismi
- have reached an adequate di crescitae
level ofdicritical
adattamento all’in
capacity ambiente.
researchLe comunità
and microbiche
professional e
activities
l’related
organizzazione spaziale:biorisage.
to environmental feltri, tappeti, biofilm. L’intervento microbico nei cicli di: Carbonio,
azoto, zolfo, ferro, calcio, fosforo,
The evaluation of autonomy of judgement manganese, mercurio
will take place eduring
altri elementi.
the final Iexamination.
microrganismi nei
Italiano diversi compartimenti ambientali: i) gli ambienti acquatici, generalità; acque dolci, estuari,
acque marine; interazioni con organismieucarioti in questi ambienti. ii) ambienti terrestri;
generalità,
COMMUNICATION descrizione e interazione con eucarioti in questi ambienti. iii) l’aria come
SKILLS:
ambiente e il suo controllo
Upon completion of the course microbiologico.
students will: iv) ambienti estremi. I diversi tipi di interazione
tra
-bemicrorganismi;
able to organise, il“Qpresent
uorumSensing” . Biodegradazione
and communicate microbicaor
their knowledge deithe
composti
results of organici
their
naturali e di sintesi (fattori
research, both in written and oral formche influenzano la degradazione di un composto organico,
degradazione
- have a mastery di cellulosa, chitina microbiology
of enviromental e lignina, degradazione degli idrocarburi,
aspects to allow regolazione
interaction with other
delle vie cataboliche,
operators closely linked plasmidi catabolici).monitoring
to enviromental Microrganismi e inquinamento.Uso
(geologists, delle capacità
virologists, geneticists,
biodegradative
molecular biologists, microbiche per il risanamento
agronomists ambientale (tecniche di biorisanamento,
and bioinformaticians)
biorisanamento in situ ed ex situ; ruolo degli MGM).Trattamento dei rifiuti: solidi (discariche,
Mod. scheda Attività Formativa v.1.0
compostaggio)
LEARNING SKILLS: e liquidi (reflui-¬‐trattamenti a filtri percolatori e a fanghi attivi);
aria/biofiltrazione.
Upon completion of Ambiente,
the course, microrganismi
students should:e salute: Microrganismi patogeni ambientali:
esempi di infezioni trasmesse
-learn independently all'uomo
from a variety dall'ambiente (infezioni a trasmissione aerea e
of sources;
idrica) e caratteristiche biologiche principali di alcuni dei patogeni coinvolti (Legionella,Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”
Scheda Insegnamento/Attività Formativa
Taxonomy and phylogeny of microorganisms; the main functional groups in different
evolutionary phylum. The mechanisms of growth and adaptation to the environment. The
microbial communities and the spatial organization: felts, mats, biofilms. The microbial
intervention in cycles: carbon, nitrogen, sulfur, iron, calcium, phosphorus, manganese,
Inglese mercury, and other elements. The microorganisms in different environmental
compartments: i) aquatic environments, generality; freshwater, estuaries, marine waters;
interactions with eukaryotic organisms in these environments. ii) land environments;
generality, description and interaction with eukaryotes in these environments. iii) the air like
environment and its microbiological control. iv) extreme environments. The different types
of interaction between microorganisms; the "Quorum Sensing". Microbial biodegradation of
the organic and synthetic compounds (factors that affect the degradation of organic
compound, the degradation of cellulose, chitin and lignin,degradation of hydrocarbons,
Modalità di svolgimento
regulation of catabolic pathways, catabolic plasmids). Microorganisms and pollution. Use of
microbial biodegradation capacity for environmental remediation (bioremediation
Modalità techniques,
in presenza in situ and ex situ bioremediation; role of MGM). Waste treatment: solid
Modalità (landfills,
a distanza composting) and liquid (wastewater-¬‐treatment in trickling filters and activated
sludge); air / biofiltration. Environment, microorganisms and health: Environmental
Testo
Descrizione della
Pathogens;fisso
modalità 2 di svolgimento
examples of infections e metodi didattici
transmitted adottati
to humans from the environment
(infectionstransmitted by air and water) and biological characteristics of the major
pathogens involved (Legionella, Bacillus anthracis, Salmonella, Shigella, Vibrio, hepatitis
Lezioni
Virus A Frontali e seminariGiardia lamblia). Methods in environmental microbiology. Assays
andE, Norovirus,
used for the detection of bacteria and viruses in environmental samples. (PCR,
Italiano epifluorescence microscopy, fluorescence in situ hybridization--‐FISH, antigen-¬‐antibody
reactions) Analysis of microbial diversity in environmental samples: molecular fingerprinting
techniques
Testo fisso (ARDRA,
2 RLFP, TRLFP, DDGE, TTGE), Metagenomics (Screening of clone
libraries, emulsion PCR and next generation sequencing).
Frontal Lessons and Seminars
Inglese
Modalità di frequenza
Frequenza obbligatoria
Frequenza facoltativa
Mod. scheda Attività Formativa v.1.0Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”
Scheda Insegnamento/Attività Formativa
Descrizione della modalità di frequenza
La frequenza di lezioni ed esercitazioni è fortemente consigliata, sebbene non obbligatoria
Italiano
Testo fisso 2
Attendance at lectures and practical exercises is strongly recommended, although not
mandatory
Inglese
Modalità di valutazione
Prova scritta
Prova orale
Valutazione in itinere
Valutazione di progetto
Valutazione di tirocinio
Prova pratica
Prova di laboratorio
Descrizione delle modalità e dei criteri di verifica dell’apprendimento
La prova sarà un intervista per valutare la conoscenza delle nozioni di base e specifiche. La
valutazione sarà basata sul verificare la capacità di comunicare e comprendere le nozioni
trattate nel corso e la capacità di integrarle i diversi argomenti del corso.
Italiano
Mod. scheda Attività Formativa v.1.0Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”
Scheda Insegnamento/Attività Formativa
The test will be an interview to assess your knowledge of the basics and specifications. The
evaluation will be based on verifying the ability to communicate the notions, demonstrating
their congruity together with the ability to integrate information between different topics.
Inglese
Testi adottati
Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica (CEA) a cura di Barbieri,
Bestetti, Galli, Zannoni. Consultazione: Brock-• ‐Biologia dei microrganismi 2A(CEA); M.C.
Italiano Thaller. Gli invisibili compagni (I microbi e l'ambiente) 2007 Universitalia.
Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica (CEA) a cura di Barbieri,
Bestetti, Galli, Zannoni. Consultazione: Brock-• ‐Biologia dei microrganismi 2A(CEA); M.C.
Inglese Thaller. Gli invisibili compagni (I microbi e l'ambiente) 2007 Universitalia.
Bibliografia di riferimento
Italiano
Inglese
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