Matematica epidemiologica per - COVID-19 - ithaca ...

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Matematica
epidemiologica per
COVID-19
Simone Bianco                 IBM Almaden Research Center, NSF Center for Cellular Construction

Sara Capponi                  IBM Almaden Research Center, NSF Center for Cellular Construction

James H. Kaufman              IBM Almaden Research Center

Introduzione                                               sione della malattia in quel preciso momento. I
                                                           primi studi sono stati molto influenti nella rea-
L’epidemia di COVID-19, una malattia altamente             lizzazione e attivazione di diversi interventi di
contagiosa causata dal virus RNA SARS-CoV-2,               tipo non farmaceutico (Non pharmaceutical inter-
ha causato finora oltre 110 milioni di infetti e più       vention, NPI), messi in atto da tutti i paesi del
di 2.4 milioni di morti nel mondo. Fin dall’inizio,        mondo. Gli NPI variano in termini di rigore,
insieme all’enorme sforzo umanitario e medico,             durata e applicazione da un paese all’altro, de-
la comunità scientifica si è unita per ottenere il         terminando quindi distinti livelli di contenimen-
maggior numero di informazioni possibili sul               to e controllo della pandemia a seconda della
virus e per identificare strategie di controllo del        nazione a cui ci si riferisce. L’uso di rigorose stra-
contagio. Il risultato è stato lo sviluppo rapido di       tegie di quarantena in Cina, Colombia, Perù e
diversi vaccini ad alta efficacia, alcuni dei quali        altri paesi ha ridotto il numero di riproduzione
sono stati già adottati, da diverse nazioni a li-          di base, R0, definito come il numero di possibili
vello mondiale, mentre altri sono negli ultimi             contagiati dovuto ad un solo infetto, ad un va-
stadi della sperimentazione clinica (ricordiamo            lore inferiore ad 1 per diversi periodi, frenando
ad esempio che il vaccino italiano sviluppato dal-         fortemente l’epidemia [1]. Altri paesi hanno ap-
l’azienda biotecnologica ReiThera in stretta colla-        plicato regolamentazioni NPI meno rigide, come
borazione con lo Spallanzani è entrato nella fase          il distanziamento sociale e la restrizione di atti-
due solamente a Marzo 2021).                               vità al chiuso, riducendo il tasso di trasmissione
   Poiché la distribuzione del vaccino è attual-           di circa la metà [1].
mente in corso, lo studio dell’epidemiologia del-
la malattia è fondamentale per capire come con-              In questo articolo forniamo una breve panora-
trollarne la diffusione e per prevenire o prepa-           mica dei vari modelli epidemiologici che sono
rarsi o probabili pandemie future. I modelli ma-           stati proposti durante la prima fase della pan-
tematici di diffusione delle malattie sono stati           demia, ovvero quella di tipo strettamente epide-
sviluppati nel primo periodo della pandemia,               mico. In particolare, discuteremo dei modelli
e hanno catturato ciò che si sapeva sulla diffu-           matematici che hanno incorporato le caratteristi-

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che specifiche del virus SARS-CoV-2 rispetto ad            le interazioni tra le persone (agenti) di una popo-
altri agenti patogeni come la trasmissione asin-           lazione sono esplicitamente definite e calcolate,
tomatica e gli effetti delle regolamentazioni NPI          oppure reti complesse, ovvero costrutti matema-
non solo in termini della diffusione della pande-          tici che dividono le popolazioni nelle comunità
mia ma anche rispetto alla mobilità umana. Infi-           locali che interagiscono tra loro in termini di nodi
ne esporremo gli effetti sulle previsioni fornite          e edge. Rispetto ai modelli matematici compar-
dai modelli matematici quando viene trascura-              timentali, queste sono le alternative praticabili
ta la diffusione locale del virus rispetto a quella        specialmente nelle prime fasi di crescita esponen-
nazionale.                                                 ziale dellepidemia, in cui è importante cogliere
                                                           la natura stocastica della diffusione della malat-
                                                           tia da persona a persona in piccole popolazioni e
Breve storia della                                         realtà locali, quali uffici, mezzi di trasporto, luo-
modellizzazione matematica                                 ghi religiosi, ecc. In questo modo si è in grado
                                                           di fornire informazioni di grande interesse sulla
delle malattie infettive
                                                           diffusione delle infezioni in una comunità locale.
                                                           La granularità aggiuntiva offerta da questi meto-
I modelli matematici della diffusione delle ma-
                                                           di pero ha un costo talvolta alto dovuto ad una
lattie infettive sono stati per secoli un metodo
                                                           maggiore complessità computazionale.
efficace per controllarle e prevenirle. Il primo
studio sistematico che ha incluso l’uso di mo-                La pandemia di COVID ha evidenziato la ne-
delli matematici per le malattie infettive risale a        cessità di una rapida modellazione della malattia.
John Graunt (1620-1674) [2]. Circa un secolo più           La disponibilità di software accessibili gratuita-
tardi, nel 1760, il fisico e matematico svizzero D.        mente (open source) ha accelerato questo processo,
Bernoulli sviluppò il primo modello matemati-              consentendo trasparenza e responsabilità e pro-
co che descrive la dinamica del vaiolo [3]. Og-            muovendo la collaborazione e la rapida diffusio-
gi, i modelli epidemiologici basati su equazioni           ne della conoscenza. Lo Spatio-Temporal Epidemio-
differenziali vengono applicati ordinariamente             logical Modeler (STEM) è un esempio di software
nello studio delle malattie infettive, trasmesse da        open source usato ampiamente nel passato per de-
vettori e zoonotiche in tutto il mondo [4].                scrivere la diffusione di malattie infettive quali
    Quando la diffusione di una malattia infettiva         ad esempio SARS, Ebola, H1N15. STEM e parte
è abbastanza ampia da essere descritta dalla ma-           della Eclipse foundation ed è guidato da IBM
tematica continua, la maggior parte degli studi            Research, dall’Istituto federale tedesco per la va-
epidemiologici utilizza modelli compartimenta-             lutazione dei rischi (BfR) e da altri istituti [5].
li, cioè modelli che dividono la popolazione in            Con la diffusione mondiale del COVID, altri con-
compartimenti in base al loro stato di infezione e         sorzi stanno sviluppando modelli open source per
modellano la transizione tra compartimenti uti-            catturare l’epidemiologia di questa pandemia
lizzando equazioni matematiche. Ad esempio,                [6].
la popolazione può essere suddivisa tra suscet-
tibili alla malattia, cioè individui che non sono
mai venuti in contatto con la malattia, persone in         Modelli di trasmissione
cui la malattia è in incubazione, cioè la malattia         asintomatica
è presente ma non può ancora essere trasmessa
individui infettivi ma asintomatici, ecc. A livello        Una caratteristica cruciale del COVID-19, che lo
governativo, questi modelli sono stati per lungo           distingue da altre infezioni da Coronavirus co-
tempo usati in modo efficace per fare delle pre-           me la SARS e la MERS, è il potenziale di causare
visioni sullandamento delle malattie infettive e           una malattia così lieve che i suoi sintomi posso-
nella gestione pubblica delle epidemie. Tuttavia,          no passare inosservati in alcune persone. Questi
non sono l’unico modo per studiare e caratteriz-           casi sono difficili da monitorare e contribuisco-
zare le malattie infettive. Altri tipi di simulazioni      no a quella che viene comunemente chiamata
usano modelli basati su agenti (agent-based mode-          trasmissione asintomatica. Nei casi in cui i
ling, ABM), ovvero modelli computazionali in cui           sintomi invece sono gravi, spesso si richiedono

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cure critiche e ospedalizzazione, causando un              sviluppati in quel periodo anche se la rapida
tasso di mortalità del 2-10% a seconda della re-           identificazione degli individui asintomatici è ne-
gione e dei fattori di rischio individuali. Seb-           cessaria, ma non sufficiente per ottenere questa
bene la ragione della trasmissione asintomatica            diminuzione. In realtà studi demografici delle
sia ancora sconosciuta, l’effetto sulla prima fase         comunità più colpite dalla pandemia rivelano
dell’epidemia è stato devastante e probabilmen-            che in assenza di aiuti economici diffusi gli in-
te la trasmissione asintomatica è stata la causa           dividui sintomatici continuano ad essere l’ele-
principale della rapida diffusione mondiale di             mento trainante della diffusione dell’infezione:
COVID-19 [7].                                              in molte aree gli individui con un salario basso
   All’inizio della pandemia molti studi hanno             si trovavano di fronte alla scelta di isolarsi, per-
pertanto cercato di affrontare gli effetti della tra-      dendo tutto il reddito, o continuare a lavorare
smissione asintomatica. Inoltre, poiché i rappor-          con il rischio reale del contagio [11].
ti mostravano l’importanza della trasmissione                 Lockdown periodici, dispositivi di protezione
sia asintomatica che pre-sintomatica, nonché il            individuale e distanziamento sociale per fermare
potenziale per gli asintomatici di rappresentare           la diffusione di COVID. Le misure più immedia-
oltre il 50% tutti i casi infettivi [8], è stata rac-      te di prevenzione della diffusione delle malattie
comandata un’indagine diffusa attraverso i test            infettive di tipo respiratorio come il COVID, mol-
come possibile strategia per controllare la malat-         to prima della realizzazione di un vaccino o di
tia. Inizialmente si e pensato che una strategia           farmaci antivirali, di solito coinvolgono la chiu-
che comprendesse test di asintomatici e il raffor-         sura di scuole, luoghi di lavoro, chiese, uffici,
zamento del distanziamento sociale sarebbe stata           fabbriche e altri luoghi pubblici, incoraggiano
necessaria per mitigare la diffusione del virus [9].       il mantenimento della distanza sociale, ovvero
   Un piano del genere è stato applicato della             l’applicazione di una distanza minima di 2 m tra
Corea del Sud, dove un’ampia frazione della po-            gli individui, e includono nei casi più gravi la
polazione è stata sottoposta a screening continuo          quarantena totale e il blocco generalizzato della
[10]. Tuttavia, i risultati presentati dal nostro e da     società, il cosiddetto lockdown. Queste misure
altri gruppi hanno dimostrato chiaramente che              mirano a diminuire il tasso di contatto effettivo
anche una forte diminuzione della trasmissione             della popolazione, che a sua volta riduce il nume-
ottenuta con strategie di regolamentazione NPI e           ro di riproduzione della malattia, R0 , ma presen-
test non avrebbe comunque impedito la diffusio-            tano importanti limitazioni: è infatti impossibile
ne globale del virus (vedi [9] e bibliografia citata),     imporre un lockdown completo per lunghi perio-
ma avrebbe avuto leffetto di ridurre il picco di in-       di, a causa del grave impatto sul tessuto sociale e
cidenza (riducendo l’impatto sulle infrastrutture          sull’economia . Allo stesso tempo, la necessità di
mediche), estendendolo e ampliandolo. Questo               preservare categorie di lavoro essenziale mette
effetto e dovuto al fatto che il distanziamento            comunque a rischio una parte consistente del-
sociale ha lo scopo di rimuovere gli individui             la popolazione a causa dei possibili e frequenti
suscettibili dalla popolazione, ma non di proteg-          incontri tra queste categorie con individui asinto-
gerli attivamente dall’eventuale infezione, per            matici. La strategia di imporre lockdown periodici
cui se rimangono piccoli focolai di infezione, la          come un modo per controllare la diffusione del-
probabilità di avere una recrudescenza non è tra-          la malattia mantenendo sano il tessuto sociale
scurabile, soprattutto se le regolamentazioni NPI          ed economico della società è stata formalmente
vengono allentate troppo presto. Questo è pro-             studiata solo recentemente [12].
prio quello che è avvenuto nella seconda metà del             Laddove i lockdown sono stati allentati, la riatti-
2020, quando, a seguito di un allentamento delle           vazione di focolai di virus latenti ha aumentato la
restrizioni, si è osservato un costante aumento            morbidità e la mortalità. Inoltre, la durata del loc-
del numero di casi.                                        kdown è stata scelta empiricamente, monitorando
   Se misure restrittive come il distanziamento            il numero di nuovi casi entro un periodo simile al
sociale fossero stati accompagnate da test diffu-          limite superiore del periodo di incubazione della
si, si sarebbe osservata una forte diminuzione             malattia. Per prevenire l’insorgenza di nuove on-
dell’incidenza prevista dai modelli matematici             date infettive è dunque importante comprendere

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in maniera quantitativa gli effetti della riduzione        supposto di base consente di prevedere analiti-
anticipata del lockdown e dell’allentamento dei            camente il periodo ottimale e di fornire regioni
controlli sulle popolazioni suscettibili.                  nello spazio dei parametri che risultano in un
   Studi numerici preliminari suggeriscono che             controllo ottimale della diffusione. La logica di
la chiusura periodica di 30-50 giorni di un lockdo-        queste ipotesi è chiara: una malattia infettiva può
wn rigoroso seguita da 30-50 giorni di restrizioni         essere controllata quando (1) l’intervento è attua-
sociali non stringenti può aiutare a controllare il        to precocemente, (2) la malattia non è cronica o
rischio di epidemia, attenuando efficacemente il           non è in grado di essere trasmessa per un perio-
picco di prevalenza del COVID-19 e riducendo               do di tempo molto lungo e (3) il suo potenziale
i danni economici [13]. Un lavoro recentemente             di diffusione è tale che le regolamentazioni NPI
pubblicato introduce un approccio analitico ge-            possono effettivamente aiutare. È stato osservato
nerale per fornire una comprensione di base sul            che, a seconda dei parametri, per il COVID-19 il
perché e sul quando tali strategie di minimizza-           periodo di lockdown deve essere compreso tra 2 e
zione del rischio sono efficaci [12]. In generale, il      4 volte la durata del periodo di incubazione, che
periodo di lockdown ottimale per il COVID-19               è di circa 5 giorni14, quindi approssimativamen-
può dipendere in modo significativo dalla quan-            te tra 10 e 20 giorni. Sebbene in generale sia stato
tità di diffusione asintomatica, in particolare se         suggerito che la chiusura periodica possa aiutare
c’è una grande differenza nei tassi di infezione           a frenare la diffusione di una malattia infettiva
rispetto ai casi sintomatici. Poiché la diffusione         che si diffonde per via aerea come il COVID-19,
asintomatica è difficile da misurare direttamen-           l’applicazione di tali misure è stata, per quan-
te, specialmente nelle prime fasi di un’epidemia           to sia stato possibile appurare, principalmente
di una malattia emergente come il COVID, può               basata su osservazioni del tempo di guarigione
essere complicato stimare il controllo ottimale in         e assenza di nuovi casi per un determinato pe-
modo sufficientemente accurato affinché il lock-           riodo. Per la pianificazione di un lockdown è
down periodico sia una strategia attuabile. Una            necessaria una comprensione più quantitativa
possibile soluzione è sviluppare precocemente              degli effetti di tali misure.
test rapidi, efficaci, e diffusi all’interno di una           Oltre al distanziamento sociale e ai lockdown,
popolazione, e quindi catturare la frazione di             dispositivi di protezione individuale come le ma-
infezioni asintomatiche. Questa strategia forni-           scherine per il viso sono ora necessari per la mag-
rebbe previsioni affidabili sulla durata e sul picco       gior parte delle attività che coinvolgono persone
dell’epidemia come menzionato sopra. Se i pa-              di nuclei familiari diversi. Le mascherine per il
rametri epidemiologici di base per una malattia            viso sono di gran lunga il metodo di prevenzione
emergente sono noti, si prevede che la chiusura            delle infezioni più ampiamente diffuse, disponi-
periodica sia efficace e produca riduzioni signifi-        bile ed economico, infatti esse agiscono come
cative nella dimensione finale dell’epidemia se            una barriera alla diffusione del virus sia per un
il carico epidemico non è troppo elevato.                  individuo infetto (protezione esterna) sia per un
   Poiché i lockdown periodici incidono principal-         individuo suscettibile di essere contagiato (pro-
mente sulla frequenza di contatto, esiste un pe-           tezione interna). Coprendo la zona del naso e
riodo ottimale che minimizza in modo naturale              della bocca, le mascherine chirurgiche per il vi-
le dimensioni dell’epidemia della malattia. Le             so forniscono un livello di filtrazione che bloc-
ipotesi di base importanti sono che il numero di           ca la trasmissione del virus , riducendola fino
riproduzione della malattia R0 sia inferiore ad            al 95%15, mentre le persone non infette che in-
una soglia, che può essere calcolata analiticamen-         dossano una maschera chirurgica sono protette
te, e che il tempo di incubazione e di recupero            fino all’85% dalla contrazione dell’infezione [16].
siano simili, cioè che la malattia non sia croni-          L’efficacia delle mascherine nel prevenire la dif-
ca. Il presupposto di base per l’esistenza di un           fusione delle malattie è dovuta al controllo degli
controllo così ottimale dell’epidemia attraverso           aerosol, la principale modalità di trasmissione
lockdown periodici si basa sulla identificazione           del virus SARS-CoV-2 [17].
precoce della diffusione della malattia, ovvero               Poiché le mascherine per il viso sono state uti-
su un numero di infetti ancora basso. Tale pre-            lizzate in passato durante le epidemie di influen-

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za e SARS e le pandemie di influenza, la loro              ciale e l’uso della mascherina siano sinergici nella
utilità è stata studiata estensivamente usando             prevenzione delle epidemie di COVID-19. In par-
modelli matematici, che hanno mostrato l’effi-             ticolare, il distanziamento sociale è vantaggioso
cacia effettiva dell’utilizzo di mascherine nella          solo se accompagnato da una diffusa adesione
prevenzione delle epidemie. D’altro canto, non             della popolazione alla sua attuazione, al contra-
sono molti gli studi che considerano la combina-           rio, indossare le mascherine è molto efficace per
zione tra le varie forme di isolamento e allontana-        ridurre la diffusione dell’infezione. Ancora una
mento sociale e le mascherine o altri dispositivi          volta, questo è in parte una conseguenza dell’alto
di protezione individuale. Nel 2010 almeno due             tasso di trasmissione asintomatica. Tuttavia, il
articoli hanno studiato l’effetto dell’uso della ma-       distanziamento sociale rimane una misura neces-
scherina per contrastare la diffusione della nuova         saria per appiattire la curva epidemica in assenza
influenza A (H1N1)18,19. Più specificamente ri-            di un vaccino.
guardo al COVID-19, l’efficacia di indossare la
mascherina è stata recentemente studiata utiliz-
zando un modello a equazioni differenziali ordi-
narie (ordinary differential equations, ODE), che
considera tra gli altri parametri una percentuale
variabile di individui asintomatici, il rispetto del       Mobilità e lockdown
mandato di indossare mascherine, e una diversa
efficacia di protezione interna ed esterna [20].
   In generale, il problema è stato studiato in di-        L’aggiunta di complessità a qualsiasi modello
versi articoli utilizzando modelli basati su agenti,       matematico per ottenere ulteriori informazioni
ciascuno focalizzato su una parte specifica della          deve essere bilanciata con l’incertezza associata
catena dell’infezione: in alcuni casi non è stata          all’aggiunta di parametri necessari per descrive-
considerata la presenza di individui infetti asin-         re la domanda che si vuole affrontare scientifica-
tomatici [21, 22], in altri l’efficacia di indossare       mente . Ad esempio, l’importanza di aggiungere
maschere non è stata analizzata se combinata               la stratificazione per età è ben nota, ma un tale
con altri NPI23, infine, la differenza di prote-           modello richiederebbe l’introduzione di parame-
zione verso l’interno e verso l’esterno data da            tri che descrivano la prevalenza della malattia
una mascherina è stata spesso trascurata o pa-             nelle varie fasce d’età. Questo viene fatto di rou-
rametrizzata con un unico valore [24]. Hoertel             tine per malattie come il morbillo, ma diventa
et al. [25] hanno condotto un’indagine piutto-             problematico nello studio di malattie emergenti
sto completa basata sui dati di tutti questi effetti.      come il COVID, in cui i dati demografici potreb-
Tuttavia, i loro risultati sono specificatamente ri-       bero non essere ancora disponibili. Studiando
feriti alla Francia e l’elevata dimensionalità dello       l’effetto di strategie NPI come il distanziamento
spazio dei parametri del modello rende difficile           sociale sulla diffusione di SARS-COV-2 è possibi-
districare l’effetto dei vari interventi e applicare       le suddividere esplicitamente la popolazione su-
in modo diretto questo stesso modello ad altri             scettibile al contagio tra gruppi che si mescolano
paesi.                                                     e gruppi che invece sono in lockdown o quarante-
   Una recente pubblicazione ha proposto un mo-            na e, quindi, non esposti al contatto con persone
dello basato su agenti in cui è stata misurata l’ef-       contagiose. Tale studio richiederebbe come in-
ficacia relativa di indossare le mascherine per il         put dei dati sulla mobilità della popolazione e
viso per ridurre la diffusione di COVID-19 in pre-         sui cambiamenti nella mobilità di una popola-
senza di individui asintomatici in combinazione            zione per regione e nel tempo. Fortunatamente,
con il distanziamento sociale [26]. Per sviluppare         tali dati indipendenti sono già disponibili per
modelli che descrivono scenari di epidemia sem-            l’uso [27, 28, 29]. Incorporando questi dati in
pre più realistici sono necessarie simulazioni sto-        un modello appropriato, sarà possibile osserva-
castiche di grandi dimensioni al computer e com-           re una variazione dell’errore di predizione del-
putazionalmente costose della diffusione dell’in-          l’incidenza, aumentando la nostra fiducia nelle
fezione. Non sorprende che il distanziamento so-           previsioni.

Ithaca: Viaggio nella Scienza XVII, 2021 • Matematica epidemiologica per COVID-19                            9
Previsione iperlocale per                                  sociali ed economiche deve essere applicata dalle
l’allocazione delle risorse                                autorità responsabili su scala spaziale rilevante
                                                           per le giurisdizioni locali, decisioni attuabili co-
sanitarie                                                  me la chiusura di ristoranti o l’annullamento di
                                                           interventi chirurgici pianificati per aumentare
Un presupposto importante della maggior parte
                                                           la capacità di terapia intensiva devono riflette-
degli studi di sviluppo di modelli matematici
                                                           re le condizioni locali. Una pianificazione delle
basati su ODE è indicato come homogenous mi-
                                                           risorse basata su un modello di incidenza della
xing. Secondo questo principio, ogni individuo
                                                           malattia statale o nazionale è troppo approssi-
in una popolazione ha una certa probabilità di
                                                           mativo e impreciso e può portare a strategie di
incontrare tutti gli altri individui. Questa idea
                                                           intervento o troppo lasche a livello locale o inutil-
nasce dal campo delle reazioni chimiche, che sto-
                                                           mente rigide e gravose. Già stati degli USA come
ricamente ha fornito le basi matematiche per lo
                                                           la California o paesi come l’Italia, ad esempio,
studio teorico delle malattie infettive: così come
                                                           hanno adottato strategie di restrizioni e blocchi
le specie chimiche in una miscela che entrano in
                                                           regionali, che variano geograficamente in base
contatto, possono reagire, e cambiare stato, in
                                                           ai valori regionali del numero riproduttivo della
modo analogo gli individui suscettibili che entra-
                                                           malattia R0 .
no in contatto con gli individui infetti possono
cambiare stato e essere contagiati. L’ipotesi di
una popolazione in regime di homogeneous mi-
                                                           Conclusioni
xing è ovviamente un’idealizzazione e si realizza
solo approssimativamente quando la densità di              Sviluppare un modello di una pandemia di una
popolazione è molto alta.                                  malattia emergente come il COVID-19 richiede
   La pandemia di COVID-19 ha portato molti                l’integrazione di più flussi di dati. Le previsione
sistemi sanitari sull’orlo del collasso. Le unità di       sugli esiti della pandemia basate su modelli ma-
terapia intensiva (ICU) e i letti ospedalieri sono         tematici rigorosi sono fondamentali, ma, come
stati assegnati dinamicamente per compensare               mostriamo in questo articolo, l’accuratezza delle
i pazienti bisognosi di cure critiche durante le           previsioni dipende da diversi fattori legati a va-
varie ondate di infezione. Poiché negli USA e in           rie discipline come la biologia, l’epidemiologia,
altre parti del mondo l’allocazione delle risorse          l’economia, ecc. Il potere predittivo dei modelli
è lasciata ai governi locali, i limiti dell’appros-        matematici cambia con un corpus crescente di
simazione dell’homogeneous mixing quando un                informazioni disponibili e lo sviluppo di nuovi
modello matematico è usato per prevedere il nu-            metodi basati sui dati con l’integrazione e l’a-
mero di casi della malattia deve essere testato in         nalisi dei dati alimentati dall’intelligenza artifi-
un contesto realistico.                                    ciale avrà sicuramente un impatto nel prossimo
   Una recente analisi ha dimostrato che se con-           futuro, probabilmente prima che questa pande-
sideriamo come livello geografico una nazione o            mia sia finita. I modelli matematici rimangono
una provincia o macroregione (ad esempio, uno              un potente strumento per comprendere una ma-
stato degli USA), le popolazioni non sono certa-           lattia e la sua diffusione nella popolazione. Le
mente ben mescolate. Negli USA è possibile otte-           recenti notizie sull’esistenza di diverse varian-
nere una previsione accurata a livello di contea,          ti genetiche del virus SARS-CoV-2, ognuna con
sebbene questo richieda lo sviluppo di un model-           il potenziale di diffondersi più velocemente o
lo iperlocale che esplicitamente tenga conto della         di essere più mortale, rappresenta un’altra im-
risoluzione spaziale della densità abitativa [30].         portante opportunità per i ricercatori di fornire
Il modello di una regione della dimensione di              previsioni tempestive e accurate per una migliore
uno stato americano non è in grado di prevede-             pianificazione delle risorse, purtroppo limitate,
re con abbastanza precisione la diffusione della           per combattere questa malattia.
malattia a livello delle comunità nelle subregio-
ni più piccole, con conseguenti grandi errori di
previsione. Poiché una pianificazione efficace                               Z      M      Y
delle regolamentazioni NPI e di altre strategie

Ithaca: Viaggio nella Scienza XVII, 2021 • Matematica epidemiologica per COVID-19                            10
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                      \      d     [

Simone Bianco: è un membro dello staff di ricer-
ca presso l’IBM Almaden Research Center, dove
dirige il laboratorio di ingegneria cellulare. Ha
conseguito la laurea e la laurea specialistica in
Fisica presso l’Università di Pisa, in Italia, e il
dottorato in Fisica presso l’Università del Nord
Texas. I suoi principali interessi di ricerca riguar-
dano la biologia evolutiva teorica, in particolare
l’evoluzione dei virus a RNA, l’epidemiologia e
l’ingegneria cellulare.
Sara Capponi: è postdoc presso l’IBM Almaden
Research Center ed ha una formazione in fisica,
biofisica computazionale e biochimica. In IBM
Research, sfrutta la sua esperienza per combi-
nare la modellazione molecolare con l’ingegne-
ria cellulare. Inoltre, utilizza approcci teorici
per caratterizzare la diffusione, la dinamica e la
predazione del virus.
James H. Kaufman: è uno scienziato nel set-
tore Artificial Intelligence e software cogniti-
vo presso l’IBM Almaden Research Center di
San Jose, CA. Attualmente coordina la ricer-
ca sull’utilizzo di dati molecolari per miglio-
rare la nostra comprensione delle interazioni
ospite-microbo e del fenotipo di malattia. È an-
che co-responsabile del progetto Eclipse per il
modello open source SpatioTemporal Modeler
(http://www.eclipse.org/stem).

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